More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3098 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 523 aa  1028    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  53.74 
 
 		 524 aa  509  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  52.98 
 
 		 526 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  46.08 
 
 		 521 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  40.47 
 
 		 533 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  33.53 
 
 		 534 aa  302  9e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  34.76 
 
 		 521 aa  300  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  36.93 
 
 		 521 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  37.32 
 
 		 521 aa  287  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  35.45 
 
 		 514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  38.04 
 
 		 522 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  36.34 
 
 		 521 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  34.51 
 
 		 529 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  35.05 
 
 		 511 aa  260  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  36.92 
 
 		 511 aa  259  7e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  34.84 
 
 		 511 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  36.36 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  32.96 
 
 		 528 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  36.89 
 
 		 530 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  31.87 
 
 		 523 aa  250  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  35.98 
 
 		 511 aa  249  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  36.6 
 
 		 522 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  34.36 
 
 		 511 aa  243  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  34.03 
 
 		 534 aa  243  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  34.38 
 
 		 511 aa  242  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  35.78 
 
 		 521 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  35.14 
 
 		 511 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  35.14 
 
 		 511 aa  241  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  36.99 
 
 		 521 aa  242  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  35.14 
 
 		 511 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  35.14 
 
 		 511 aa  241  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  34.91 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  34.91 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  34.91 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  34.64 
 
 		 508 aa  241  2.9999999999999997e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  34.91 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  34.91 
 
 		 511 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  36.83 
 
 		 522 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  33.72 
 
 		 522 aa  240  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  37.31 
 
 		 556 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  35.52 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  35.48 
 
 		 526 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  32.23 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  35.92 
 
 		 512 aa  237  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  34.56 
 
 		 521 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  31.54 
 
 		 512 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  35.33 
 
 		 512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  35.33 
 
 		 512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  34.05 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  30.71 
 
 		 531 aa  235  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 		 512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  33.76 
 
 		 516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 		 512 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 		 520 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  33.88 
 
 		 530 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  32.8 
 
 		 517 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  33.7 
 
 		 511 aa  231  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  33.88 
 
 		 530 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  34.67 
 
 		 542 aa  230  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  35.68 
 
 		 512 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  34.22 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  35.28 
 
 		 512 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  36.05 
 
 		 515 aa  227  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  35.48 
 
 		 512 aa  226  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  32.89 
 
 		 517 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  33.21 
 
 		 531 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  35.13 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  35.13 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  35.41 
 
 		 495 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  35.81 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  33.4 
 
 		 516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  33.55 
 
 		 514 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 		 516 aa  221  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  34.03 
 
 		 521 aa  221  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  31.29 
 
 		 519 aa  220  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 		 494 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  34.96 
 
 		 521 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  33.61 
 
 		 573 aa  218  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  30.68 
 
 		 525 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  35.46 
 
 		 528 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 		 532 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 		 521 aa  216  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  32.7 
 
 		 524 aa  216  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  32.95 
 
 		 519 aa  216  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  31.5 
 
 		 534 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  34.44 
 
 		 512 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  34.51 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  36.34 
 
 		 535 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 		 545 aa  213  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  33.72 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  36.1 
 
 		 535 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>