More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2688 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  100 
 
 
523 aa  1045    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  99.04 
 
 
523 aa  1035    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  51.37 
 
 
515 aa  504  1e-141  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  51.76 
 
 
515 aa  502  1e-141  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  49.41 
 
 
530 aa  498  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  52.02 
 
 
495 aa  496  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  48.63 
 
 
518 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  46.06 
 
 
524 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  47.52 
 
 
512 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  46.06 
 
 
524 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  46.06 
 
 
524 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  46.06 
 
 
524 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  46.06 
 
 
524 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  46.53 
 
 
511 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  46.53 
 
 
511 aa  467  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  45.54 
 
 
511 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  46.53 
 
 
511 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  47.28 
 
 
522 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  49.09 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  45.97 
 
 
511 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  45.65 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  45.65 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  47.33 
 
 
512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  45.85 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  45.85 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  46.34 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  45.15 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  45.65 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  45.85 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  45.85 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  45.85 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  47.33 
 
 
512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  45.65 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  46.12 
 
 
519 aa  451  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  48.12 
 
 
512 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  47.33 
 
 
511 aa  448  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  45.52 
 
 
525 aa  449  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  47.52 
 
 
512 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  44.29 
 
 
542 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  44.55 
 
 
511 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  47.24 
 
 
512 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  47.34 
 
 
522 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  45.85 
 
 
512 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  46.35 
 
 
517 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  46.35 
 
 
517 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  45.61 
 
 
523 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  44.29 
 
 
524 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  46.24 
 
 
521 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  46.12 
 
 
533 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  43.71 
 
 
519 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  43.71 
 
 
519 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  45.06 
 
 
513 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  44.79 
 
 
521 aa  435  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  45.85 
 
 
511 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  44.07 
 
 
508 aa  433  1e-120  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  44.77 
 
 
519 aa  435  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  46.15 
 
 
513 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  43.91 
 
 
519 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  44.42 
 
 
519 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  45.04 
 
 
505 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  43.88 
 
 
519 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  44.59 
 
 
516 aa  429  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  50.44 
 
 
512 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  45.44 
 
 
521 aa  430  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  43.98 
 
 
520 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  43.88 
 
 
519 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  44.23 
 
 
519 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  44.23 
 
 
519 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  44.23 
 
 
519 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  44.19 
 
 
519 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  44.03 
 
 
519 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  43.82 
 
 
519 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  49.56 
 
 
512 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  44.95 
 
 
512 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  44.02 
 
 
518 aa  419  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  42.97 
 
 
531 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  43.71 
 
 
519 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  45.74 
 
 
528 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  44.9 
 
 
516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  46.58 
 
 
513 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  49.77 
 
 
514 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  45.45 
 
 
512 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  42.94 
 
 
534 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  44.07 
 
 
522 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  42.64 
 
 
517 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  41.33 
 
 
516 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  40.74 
 
 
534 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  41.81 
 
 
530 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  44.02 
 
 
516 aa  392  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  41.86 
 
 
530 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5882  virulence factor MVIN-like  42.05 
 
 
516 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.480668 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  43.44 
 
 
516 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  40.12 
 
 
516 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  41.01 
 
 
516 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  44.61 
 
 
536 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  40.12 
 
 
516 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  44.61 
 
 
536 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1938  integral membrane protein MviN  41.62 
 
 
546 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.919423  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2574  integral membrane protein MviN  41.86 
 
 
516 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2550  integral membrane protein MviN  41.86 
 
 
516 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>