More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1610 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 514 aa  1000    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  38.05 
 
 		 514 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  32.59 
 
 		 521 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  31.99 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  36.57 
 
 		 521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  33.6 
 
 		 529 aa  233  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  33.55 
 
 		 523 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  33.62 
 
 		 528 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  31.2 
 
 		 531 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  35.38 
 
 		 521 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  32.68 
 
 		 521 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  32.74 
 
 		 613 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  32.41 
 
 		 522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  30.37 
 
 		 514 aa  212  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  31.71 
 
 		 516 aa  210  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 		 521 aa  209  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  31.9 
 
 		 530 aa  207  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  30.39 
 
 		 523 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  35.1 
 
 		 524 aa  205  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3077  integral membrane protein MviN  36.34 
 
 		 543 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112933  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 		 522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  29.64 
 
 		 494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  34.34 
 
 		 541 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  27.45 
 
 		 495 aa  201  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  30.04 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  31.58 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  33.2 
 
 		 522 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  30.43 
 
 		 511 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  29.64 
 
 		 519 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  28.19 
 
 		 512 aa  196  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  31.59 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  26.1 
 
 		 494 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  29.31 
 
 		 515 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3190  integral membrane protein MviN  33.49 
 
 		 599 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000159661  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  32.22 
 
 		 511 aa  193  8e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2971  integral membrane protein MviN  31.96 
 
 		 525 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  30.89 
 
 		 495 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  32.97 
 
 		 521 aa  191  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  29.31 
 
 		 515 aa  191  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  30.22 
 
 		 526 aa  190  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  33.2 
 
 		 528 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 		 519 aa  190  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  29.07 
 
 		 505 aa  189  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  30.21 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  32.07 
 
 		 522 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.4 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  32.3 
 
 		 522 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  34.38 
 
 		 526 aa  187  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  27.55 
 
 		 511 aa  186  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  31.25 
 
 		 513 aa  186  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  28.52 
 
 		 501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  31.03 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  32.46 
 
 		 533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  27.43 
 
 		 549 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  27.19 
 
 		 519 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 		 511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  27.19 
 
 		 519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 521 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 556 aa  183  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  31.64 
 
 		 517 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  31.64 
 
 		 517 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  27.18 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  27.7 
 
 		 518 aa  182  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  27.68 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  30.14 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  27.92 
 
 		 519 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 		 518 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  29.38 
 
 		 516 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  28.31 
 
 		 511 aa  180  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  28.19 
 
 		 512 aa  180  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  30.55 
 
 		 512 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  31.98 
 
 		 534 aa  179  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  30.55 
 
 		 512 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  27.68 
 
 		 523 aa  179  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  27.47 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  28.13 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  28.13 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  28.13 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  28.13 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 		 519 aa  176  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  28.76 
 
 		 520 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  30.86 
 
 		 513 aa  176  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  27.79 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  30.15 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  30.28 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 		 511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 525 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  26.77 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  26.71 
 
 		 524 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>