More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0675 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 549 aa  1094    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  48.49 
 
 		 525 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  32.19 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  27.82 
 
 		 521 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  29.49 
 
 		 531 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  28.39 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  25.8 
 
 		 521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  28.13 
 
 		 523 aa  190  5e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  28.13 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  30.28 
 
 		 524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  29 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.96 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  25.37 
 
 		 514 aa  180  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  27.39 
 
 		 531 aa  179  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.64 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  28.21 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  29.04 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  27.44 
 
 		 512 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  28.17 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  26.93 
 
 		 522 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 		 511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  26.64 
 
 		 521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  27.43 
 
 		 514 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  28.06 
 
 		 511 aa  170  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  27.95 
 
 		 519 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  27 
 
 		 519 aa  170  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 		 524 aa  170  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 		 516 aa  170  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  28.26 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  28.97 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  26.82 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  28.28 
 
 		 530 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  27 
 
 		 519 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  29.77 
 
 		 525 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  27 
 
 		 519 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  27.98 
 
 		 530 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  27.39 
 
 		 533 aa  167  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 		 519 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  27.17 
 
 		 534 aa  166  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  28.02 
 
 		 522 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  29.34 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  27.57 
 
 		 519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  27.61 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  27.21 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  27.61 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  27.61 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  27.61 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  27.61 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  25.99 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  27.49 
 
 		 495 aa  164  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  26.56 
 
 		 519 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 		 529 aa  164  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  27.73 
 
 		 512 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  28.71 
 
 		 511 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 		 511 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 		 511 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  28.71 
 
 		 511 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  26.98 
 
 		 521 aa  163  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  26.32 
 
 		 519 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  26.32 
 
 		 519 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  26.32 
 
 		 519 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  26.32 
 
 		 519 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  29.17 
 
 		 511 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 545 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  29.19 
 
 		 516 aa  161  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  27 
 
 		 523 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  27.73 
 
 		 520 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  26.32 
 
 		 519 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  28.02 
 
 		 521 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  28.41 
 
 		 519 aa  160  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 		 512 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  26.51 
 
 		 512 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  28.99 
 
 		 516 aa  160  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  28.08 
 
 		 521 aa  160  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 		 534 aa  160  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  26.2 
 
 		 512 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  28.18 
 
 		 517 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  28.18 
 
 		 517 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  26.12 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  26.46 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  26.45 
 
 		 517 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  28.48 
 
 		 517 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  31.44 
 
 		 519 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  28.07 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  26.92 
 
 		 519 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  26.52 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  25.59 
 
 		 521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  25.59 
 
 		 532 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  28.24 
 
 		 522 aa  157  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  26.73 
 
 		 505 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  27.47 
 
 		 511 aa  157  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>