More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2725 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  75.78 
 
 		 519 aa  791    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  61.49 
 
 		 531 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  78.14 
 
 		 519 aa  786    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  78.42 
 
 		 519 aa  825    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  79.3 
 
 		 519 aa  830    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  69.17 
 
 		 525 aa  725    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  79.3 
 
 		 519 aa  830    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  75.78 
 
 		 519 aa  795    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  79.69 
 
 		 519 aa  832    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 519 aa  1032    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  79.92 
 
 		 519 aa  807    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  79.3 
 
 		 519 aa  830    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  61.55 
 
 		 523 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  68.24 
 
 		 511 aa  697    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  62.21 
 
 		 518 aa  635    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  68.79 
 
 		 520 aa  712    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  78.14 
 
 		 519 aa  826    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  77.95 
 
 		 519 aa  823    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  80.66 
 
 		 524 aa  846    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  70.35 
 
 		 519 aa  748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  78.38 
 
 		 519 aa  818    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  81.08 
 
 		 521 aa  822    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  65.75 
 
 		 521 aa  671    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  78.88 
 
 		 519 aa  803    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  60.24 
 
 		 505 aa  609  1e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  52.8 
 
 		 518 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  51.18 
 
 		 530 aa  495  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  51.9 
 
 		 495 aa  483  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  53.38 
 
 		 512 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  48.86 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  51.99 
 
 		 522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  49.24 
 
 		 533 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  45.32 
 
 		 516 aa  449  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  48.51 
 
 		 498 aa  443  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  43.88 
 
 		 523 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  43.88 
 
 		 523 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  43.02 
 
 		 511 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  46 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  44.09 
 
 		 511 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  42.64 
 
 		 511 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  46.2 
 
 		 515 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  42.83 
 
 		 511 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  45.87 
 
 		 511 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  42.72 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  42.72 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  42.72 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  43.86 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  43.86 
 
 		 542 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  42.72 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  42.72 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  43.27 
 
 		 511 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  43.22 
 
 		 511 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  42.83 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  43.61 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  42.83 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  41.86 
 
 		 511 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  42.52 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  42.52 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  43.31 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  42.52 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  44.89 
 
 		 521 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  42.52 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  42.52 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  42.52 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  42.52 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  42.52 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  43.61 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  43.57 
 
 		 517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  43.57 
 
 		 517 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  42.52 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  43.73 
 
 		 516 aa  403  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  43.5 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  40.47 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  43.73 
 
 		 516 aa  402  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  43.5 
 
 		 512 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  43.77 
 
 		 512 aa  398  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  42.94 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  43.26 
 
 		 534 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  44.06 
 
 		 522 aa  391  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  44.04 
 
 		 516 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  44.03 
 
 		 528 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1838  integral membrane protein MviN  45.68 
 
 		 529 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  43.55 
 
 		 512 aa  379  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  42.97 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  45.18 
 
 		 529 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  45 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  42.33 
 
 		 536 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  42.14 
 
 		 536 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  42.23 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  41.32 
 
 		 524 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  38.62 
 
 		 516 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  39.46 
 
 		 573 aa  350  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  39.57 
 
 		 530 aa  349  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  41.83 
 
 		 512 aa  349  7e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  39.52 
 
 		 530 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  36.9 
 
 		 517 aa  345  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  37.67 
 
 		 534 aa  341  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  42.23 
 
 		 520 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  36.54 
 
 		 516 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  37.55 
 
 		 517 aa  330  5.0000000000000004e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>