More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0298 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  100 
 
 
522 aa  1007    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  53.51 
 
 
510 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  44.64 
 
 
512 aa  358  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  44.51 
 
 
513 aa  345  8e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  45.45 
 
 
525 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  43.21 
 
 
528 aa  323  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  38.49 
 
 
529 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  39.48 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  44.1 
 
 
508 aa  320  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  43.84 
 
 
514 aa  317  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  41.12 
 
 
513 aa  316  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  42.71 
 
 
513 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  42.22 
 
 
495 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  44.42 
 
 
509 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  44.62 
 
 
509 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  41.86 
 
 
543 aa  313  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  42.26 
 
 
530 aa  313  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  37.97 
 
 
524 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  37.97 
 
 
524 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  37.97 
 
 
524 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  37.97 
 
 
524 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  37.97 
 
 
524 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  42.51 
 
 
513 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  36.65 
 
 
511 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  38.46 
 
 
511 aa  310  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  38.46 
 
 
511 aa  310  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  38.46 
 
 
511 aa  310  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  38.46 
 
 
511 aa  310  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  38.26 
 
 
511 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  38.26 
 
 
511 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  43.8 
 
 
523 aa  310  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  38.26 
 
 
511 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  38.26 
 
 
511 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  38.26 
 
 
511 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  37.45 
 
 
511 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  36.45 
 
 
511 aa  306  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  39.01 
 
 
512 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  39.09 
 
 
529 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  39.09 
 
 
555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  36.45 
 
 
542 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  41.81 
 
 
529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  38.17 
 
 
511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  41.11 
 
 
509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  37.31 
 
 
511 aa  304  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  37.05 
 
 
511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  38.14 
 
 
512 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  41.62 
 
 
514 aa  303  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  38.14 
 
 
512 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  37.94 
 
 
512 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  44.27 
 
 
525 aa  300  5e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  37.38 
 
 
512 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  40.24 
 
 
508 aa  296  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  40.49 
 
 
532 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  36.45 
 
 
512 aa  296  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  39.76 
 
 
517 aa  296  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  39.76 
 
 
517 aa  296  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  41.39 
 
 
522 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  42.44 
 
 
535 aa  294  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  37.85 
 
 
511 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  36.42 
 
 
513 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  38.44 
 
 
520 aa  292  8e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  39.42 
 
 
521 aa  293  8e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  44.7 
 
 
509 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  38.35 
 
 
509 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  37.86 
 
 
528 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  43.68 
 
 
519 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  40.23 
 
 
515 aa  288  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  37.05 
 
 
528 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  37.67 
 
 
526 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  40.32 
 
 
534 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  40 
 
 
515 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  39.2 
 
 
509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  38.93 
 
 
514 aa  284  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  37.61 
 
 
523 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  38.18 
 
 
512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  37.96 
 
 
512 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  37.74 
 
 
512 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  38.28 
 
 
518 aa  282  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  33.13 
 
 
508 aa  281  1e-74  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  35.22 
 
 
505 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  38.76 
 
 
522 aa  281  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  36.49 
 
 
523 aa  279  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  40.04 
 
 
509 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  34.6 
 
 
519 aa  276  9e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  41.06 
 
 
508 aa  274  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  40.91 
 
 
512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  44.44 
 
 
509 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  35.89 
 
 
523 aa  273  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  39.58 
 
 
498 aa  272  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  37.71 
 
 
528 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  37.11 
 
 
573 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  41.42 
 
 
522 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  39.78 
 
 
534 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  35.45 
 
 
516 aa  270  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  35.66 
 
 
534 aa  270  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  32.93 
 
 
495 aa  269  8e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  36.36 
 
 
533 aa  268  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  38.88 
 
 
520 aa  268  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  36.49 
 
 
516 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  37.33 
 
 
511 aa  265  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>