More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0044 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  63.64 
 
 
529 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  65.06 
 
 
529 aa  674    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  96.76 
 
 
528 aa  981    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  65.06 
 
 
555 aa  653    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  76.37 
 
 
532 aa  767    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  100 
 
 
526 aa  1036    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  66.6 
 
 
535 aa  618  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  56.44 
 
 
520 aa  541  9.999999999999999e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  51.92 
 
 
528 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  48.46 
 
 
512 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  45.05 
 
 
514 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  41.76 
 
 
513 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  45.5 
 
 
514 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  41.44 
 
 
513 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  41.25 
 
 
513 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  47.36 
 
 
543 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  40.83 
 
 
525 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  43.13 
 
 
515 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  40.26 
 
 
534 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  43.16 
 
 
513 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  38.02 
 
 
522 aa  296  7e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  40.12 
 
 
508 aa  287  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  40.04 
 
 
509 aa  283  5.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  41.32 
 
 
509 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  41.1 
 
 
509 aa  282  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  37.8 
 
 
509 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  38.02 
 
 
509 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  40.27 
 
 
523 aa  279  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  40.43 
 
 
519 aa  276  7e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  39.51 
 
 
525 aa  276  9e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  35.8 
 
 
521 aa  270  4e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  37.82 
 
 
534 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 
508 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  37.7 
 
 
522 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  41.97 
 
 
510 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  37.62 
 
 
509 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  39.57 
 
 
509 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  34.62 
 
 
528 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  34.99 
 
 
511 aa  262  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  36.49 
 
 
511 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  33.91 
 
 
511 aa  261  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  33.84 
 
 
511 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  33.71 
 
 
573 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  41.51 
 
 
509 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 
524 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 
524 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 
524 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  33.53 
 
 
511 aa  256  6e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 
524 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 
524 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0011  integral membrane protein MviN  37.45 
 
 
518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0453851  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  36.73 
 
 
529 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  34.48 
 
 
511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  36.69 
 
 
509 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  34.61 
 
 
517 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  34.61 
 
 
517 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  35.16 
 
 
511 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  32.81 
 
 
495 aa  251  3e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  34.66 
 
 
522 aa  250  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 
517 aa  249  9e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  33.4 
 
 
516 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  35.23 
 
 
512 aa  249  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0037  putative virulence factor MviN-like protein  37.16 
 
 
518 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236522  normal  0.272739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  35.34 
 
 
545 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  33.47 
 
 
523 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  33.47 
 
 
523 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  35.71 
 
 
495 aa  246  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  38.44 
 
 
508 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  40.04 
 
 
509 aa  246  9e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  35.14 
 
 
511 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  35.14 
 
 
511 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  35.14 
 
 
511 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  35.14 
 
 
511 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  34.91 
 
 
511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  34.91 
 
 
511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  34.91 
 
 
511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  34.91 
 
 
511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  34.91 
 
 
511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  35.54 
 
 
512 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  36.26 
 
 
518 aa  243  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  34.25 
 
 
511 aa  242  9e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  35.74 
 
 
513 aa  242  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  34.25 
 
 
542 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  35.96 
 
 
530 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  33.01 
 
 
534 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  33.4 
 
 
512 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  34.18 
 
 
512 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 
512 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  32.76 
 
 
508 aa  239  5.999999999999999e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  34.45 
 
 
519 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  33.99 
 
 
519 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  32.89 
 
 
512 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  32.75 
 
 
530 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  35.86 
 
 
521 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  32.89 
 
 
512 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  32.88 
 
 
512 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  32.68 
 
 
530 aa  236  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  37.78 
 
 
511 aa  236  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  37.67 
 
 
521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  37.16 
 
 
511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>