More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0425 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  76.37 
 
 		 526 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  75.94 
 
 		 528 aa  789    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  61.86 
 
 		 529 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 532 aa  1052    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  61.67 
 
 		 555 aa  622  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  60.91 
 
 		 529 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  62.34 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  54.26 
 
 		 520 aa  521  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  50.86 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  48.28 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  45.38 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  42.23 
 
 		 513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  42.03 
 
 		 513 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  42 
 
 		 513 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  42.34 
 
 		 525 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  45.13 
 
 		 514 aa  344  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  47.09 
 
 		 543 aa  339  9e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  42.58 
 
 		 515 aa  336  5e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  45.53 
 
 		 513 aa  327  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  40.58 
 
 		 522 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  39.96 
 
 		 534 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  42.5 
 
 		 523 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  40.17 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  40.55 
 
 		 509 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  36.33 
 
 		 517 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  36.33 
 
 		 517 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  40.27 
 
 		 509 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  40.05 
 
 		 509 aa  279  8e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  37.85 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  39.82 
 
 		 519 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  38.8 
 
 		 525 aa  272  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  36.89 
 
 		 511 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  37.9 
 
 		 534 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  34.61 
 
 		 508 aa  268  1e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  34.94 
 
 		 511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  37.74 
 
 		 508 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  35.82 
 
 		 528 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  42.45 
 
 		 510 aa  267  4e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  35.18 
 
 		 511 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  35.39 
 
 		 511 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  32.39 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  36.73 
 
 		 516 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  37.7 
 
 		 509 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  37.79 
 
 		 521 aa  263  6e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  38.19 
 
 		 509 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  33.73 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0011  integral membrane protein MviN  38.3 
 
 		 518 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0453851  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  33.73 
 
 		 523 aa  260  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 534 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  36.77 
 
 		 509 aa  260  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  34.99 
 
 		 529 aa  259  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  34.04 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  36 
 
 		 573 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  33.89 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  32.53 
 
 		 495 aa  257  5e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  39.01 
 
 		 509 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  36.44 
 
 		 512 aa  256  9e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  34.92 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  34.92 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  35.15 
 
 		 511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  34.92 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  35.15 
 
 		 511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  35.15 
 
 		 511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  35.15 
 
 		 511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  34.92 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  35.15 
 
 		 511 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  36.77 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  35.76 
 
 		 515 aa  253  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  32.84 
 
 		 542 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  32.84 
 
 		 511 aa  253  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  36.36 
 
 		 518 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  39.91 
 
 		 509 aa  250  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  35.38 
 
 		 522 aa  249  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0037  putative virulence factor MviN-like protein  37.44 
 
 		 518 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236522  normal  0.272739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  36.32 
 
 		 530 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  35.76 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  34.37 
 
 		 513 aa  247  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  36.36 
 
 		 521 aa  247  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  35.29 
 
 		 521 aa  247  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  34.02 
 
 		 545 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  36.14 
 
 		 532 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  38.28 
 
 		 511 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  39.91 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  33.65 
 
 		 512 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  35.29 
 
 		 521 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  34.96 
 
 		 512 aa  243  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5882  virulence factor MVIN-like  35.38 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.480668 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0736  integral membrane protein MviN  36 
 
 		 539 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  35.52 
 
 		 512 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  36.34 
 
 		 495 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0378  integral membrane protein MviN  36.44 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  32.68 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0921  integral membrane protein MviN  36.44 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.432333  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  34.96 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  35.73 
 
 		 522 aa  240  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>