More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0445 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 515 aa  986    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  59.06 
 
 		 513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  57.81 
 
 		 513 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  60.41 
 
 		 534 aa  551  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  57.62 
 
 		 513 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  57.78 
 
 		 514 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  58.65 
 
 		 543 aa  512  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  45.96 
 
 		 512 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  45.27 
 
 		 528 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  43.57 
 
 		 529 aa  350  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  45.11 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  42.64 
 
 		 528 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  43.76 
 
 		 555 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  45.04 
 
 		 535 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  42 
 
 		 526 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  43.21 
 
 		 529 aa  329  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  45.54 
 
 		 532 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  41.88 
 
 		 520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  45.91 
 
 		 513 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  43.51 
 
 		 525 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  41.44 
 
 		 522 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  48.88 
 
 		 510 aa  280  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  42.82 
 
 		 509 aa  259  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  40.9 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  42.82 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  39.17 
 
 		 529 aa  252  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  36.35 
 
 		 523 aa  249  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0011  integral membrane protein MviN  40.46 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0453851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  42.77 
 
 		 509 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  39.04 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  40.16 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  34.85 
 
 		 518 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  31.57 
 
 		 531 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  44.44 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  39.01 
 
 		 509 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  40.12 
 
 		 534 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  36.55 
 
 		 495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  39.81 
 
 		 573 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  35.4 
 
 		 517 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  35.4 
 
 		 517 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  40.05 
 
 		 508 aa  233  5e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  41.28 
 
 		 525 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  39.57 
 
 		 509 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  34.52 
 
 		 545 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  35.43 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  40.48 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  42.96 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  41.15 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  39.96 
 
 		 520 aa  230  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  39.04 
 
 		 509 aa  228  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  41.65 
 
 		 509 aa  227  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  33.78 
 
 		 524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  33.78 
 
 		 524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  33.78 
 
 		 524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  36.56 
 
 		 516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  33.78 
 
 		 524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  39.64 
 
 		 521 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  33.78 
 
 		 524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  34.99 
 
 		 522 aa  226  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  37.95 
 
 		 532 aa  226  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  38.38 
 
 		 521 aa  226  9e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  30.98 
 
 		 495 aa  225  1e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  32.88 
 
 		 511 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  37.32 
 
 		 522 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 		 521 aa  224  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  41.84 
 
 		 519 aa  223  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  36.56 
 
 		 530 aa  223  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  32.63 
 
 		 511 aa  223  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  32.38 
 
 		 511 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  33.33 
 
 		 521 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  35.66 
 
 		 511 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  30.86 
 
 		 508 aa  221  3e-56  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  35.52 
 
 		 511 aa  221  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  32.44 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  32.45 
 
 		 542 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  39.46 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  33.27 
 
 		 534 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  35.28 
 
 		 522 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  32.18 
 
 		 523 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  37.5 
 
 		 545 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  33.14 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  33.14 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  33.14 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  33.14 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  32.39 
 
 		 511 aa  216  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  32.88 
 
 		 523 aa  215  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  34.29 
 
 		 521 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  32.51 
 
 		 533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  34.66 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  36.51 
 
 		 521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  32.77 
 
 		 512 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  35.37 
 
 		 512 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  35.37 
 
 		 512 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  34.87 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  36.05 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>