More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2568 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  100 
 
 		 533 aa  1063    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  57.82 
 
 		 495 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  54.41 
 
 		 530 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  50.77 
 
 		 519 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  50.57 
 
 		 519 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  52.35 
 
 		 518 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  51.34 
 
 		 519 aa  487  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  51.05 
 
 		 520 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  51.24 
 
 		 519 aa  482  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  50.57 
 
 		 519 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  51.6 
 
 		 519 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  51.6 
 
 		 519 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  51.6 
 
 		 519 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  54.77 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  51.43 
 
 		 519 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  49.14 
 
 		 524 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  51.6 
 
 		 519 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  51.92 
 
 		 512 aa  478  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  50.48 
 
 		 522 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  50.78 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  50.38 
 
 		 525 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  49.33 
 
 		 519 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  48.85 
 
 		 523 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  48.38 
 
 		 519 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  49.23 
 
 		 519 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  50.38 
 
 		 521 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  48.65 
 
 		 521 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  50.38 
 
 		 519 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  49.24 
 
 		 519 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  46.69 
 
 		 523 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  46.12 
 
 		 523 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  47.95 
 
 		 505 aa  458  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  49.51 
 
 		 498 aa  452  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  46.08 
 
 		 511 aa  449  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  48.34 
 
 		 515 aa  445  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  46.42 
 
 		 516 aa  443  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  43.91 
 
 		 511 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  48.15 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  45.52 
 
 		 518 aa  444  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  44.25 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  46.33 
 
 		 531 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  44.25 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  44.87 
 
 		 512 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  44.25 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  44.25 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  43.33 
 
 		 511 aa  438  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  44.25 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  44.49 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  46.11 
 
 		 513 aa  432  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  44.73 
 
 		 511 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  44.49 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  45.29 
 
 		 511 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  44.47 
 
 		 542 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  46.27 
 
 		 521 aa  430  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  45.12 
 
 		 511 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  44.49 
 
 		 512 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  42.75 
 
 		 511 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  42.94 
 
 		 511 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  42.91 
 
 		 508 aa  422  1e-117  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  43.73 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  43.73 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  44.12 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  43.73 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  43.53 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  43.53 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  43.73 
 
 		 511 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  43.53 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  43.53 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  43.53 
 
 		 511 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  47.1 
 
 		 513 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  47.17 
 
 		 517 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  47.17 
 
 		 517 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  49.59 
 
 		 522 aa  415  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  43.92 
 
 		 534 aa  411  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  44.55 
 
 		 511 aa  411  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  44.29 
 
 		 516 aa  409  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  44.29 
 
 		 516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  44.89 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  44.6 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  43.03 
 
 		 512 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  44.15 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  43.61 
 
 		 528 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  43.87 
 
 		 516 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  43.52 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  46.62 
 
 		 513 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  43.81 
 
 		 524 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  43.91 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  42.32 
 
 		 536 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1838  integral membrane protein MviN  48.57 
 
 		 529 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  42.51 
 
 		 536 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  42.14 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  41.74 
 
 		 530 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  41.39 
 
 		 530 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  40.96 
 
 		 517 aa  364  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  43.47 
 
 		 516 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  43.31 
 
 		 516 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  40.57 
 
 		 517 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  43.04 
 
 		 516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  39.88 
 
 		 534 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0678  integral membrane protein MviN  42.62 
 
 		 539 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>