More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5302 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  74.02 
 
 
509 aa  659    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  73.62 
 
 
509 aa  656    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  92.93 
 
 
509 aa  790    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  100 
 
 
509 aa  956    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  73.14 
 
 
508 aa  626  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  74.02 
 
 
509 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  61.67 
 
 
508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  57.68 
 
 
509 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  57.45 
 
 
519 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  57.68 
 
 
534 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  57.03 
 
 
509 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  57.49 
 
 
509 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  61.76 
 
 
508 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  54.72 
 
 
509 aa  438  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  58.54 
 
 
509 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  48 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  44.44 
 
 
522 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  47.15 
 
 
513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  46.7 
 
 
513 aa  309  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  50.11 
 
 
510 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  46.47 
 
 
513 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  41.69 
 
 
529 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  42.62 
 
 
529 aa  306  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  44.68 
 
 
513 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  40.35 
 
 
529 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  44.49 
 
 
525 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  40.04 
 
 
555 aa  294  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  42.89 
 
 
535 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  33.47 
 
 
495 aa  288  1e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  42.7 
 
 
514 aa  283  5.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  35.79 
 
 
512 aa  282  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  40.6 
 
 
528 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  43.44 
 
 
514 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  39.88 
 
 
526 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  39.49 
 
 
517 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  39.49 
 
 
517 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  45.04 
 
 
543 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  40.82 
 
 
532 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  37.2 
 
 
521 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  38.33 
 
 
522 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  38.51 
 
 
511 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  43.58 
 
 
528 aa  270  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  36.04 
 
 
511 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  38.81 
 
 
520 aa  269  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  40.67 
 
 
534 aa  270  7e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  37.1 
 
 
511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  41.43 
 
 
528 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  36.58 
 
 
511 aa  264  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  37.03 
 
 
512 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  37.89 
 
 
511 aa  263  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  38.75 
 
 
518 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  36.9 
 
 
524 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  36.9 
 
 
524 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  36.9 
 
 
524 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  36.9 
 
 
524 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  36.9 
 
 
524 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  37.85 
 
 
512 aa  260  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  36.34 
 
 
511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  36.34 
 
 
511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  36.34 
 
 
511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  36.34 
 
 
511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  36.14 
 
 
511 aa  259  6e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  36.14 
 
 
511 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  36.14 
 
 
511 aa  259  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  36.14 
 
 
511 aa  259  6e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  36.14 
 
 
511 aa  259  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  36.9 
 
 
511 aa  259  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  36.64 
 
 
511 aa  259  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  37.27 
 
 
515 aa  259  8e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  38.06 
 
 
512 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  36.67 
 
 
542 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  36.21 
 
 
511 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  38.15 
 
 
512 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  36.67 
 
 
511 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  37.84 
 
 
512 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  37.81 
 
 
512 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  37.25 
 
 
512 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  42.72 
 
 
515 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  37.33 
 
 
515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  37.05 
 
 
528 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  36.2 
 
 
516 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  38.48 
 
 
530 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  34.29 
 
 
508 aa  251  2e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  39.46 
 
 
525 aa  251  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  35.96 
 
 
516 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  36.04 
 
 
513 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  38.26 
 
 
495 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  36.34 
 
 
512 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  36.93 
 
 
505 aa  246  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  38.95 
 
 
516 aa  245  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  36.34 
 
 
512 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0543  integral membrane protein MviN  40.65 
 
 
527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  36.71 
 
 
498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  37.84 
 
 
513 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  36.43 
 
 
534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  39.54 
 
 
514 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  36.07 
 
 
522 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  39.68 
 
 
523 aa  242  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  34.25 
 
 
573 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  35.91 
 
 
516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>