More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1019 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  100 
 
 
510 aa  957    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  53.6 
 
 
522 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  47.53 
 
 
512 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  48.56 
 
 
525 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  46.97 
 
 
509 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  45.12 
 
 
514 aa  364  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  45.79 
 
 
509 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  47.07 
 
 
534 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  48.58 
 
 
508 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  45.91 
 
 
513 aa  349  7e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  44.92 
 
 
509 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  41.81 
 
 
521 aa  342  7e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  45.6 
 
 
508 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  45.99 
 
 
509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  45.83 
 
 
528 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  41.5 
 
 
529 aa  332  7.000000000000001e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  42.47 
 
 
513 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  42.66 
 
 
513 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  42.52 
 
 
513 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  48.73 
 
 
509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  44.32 
 
 
530 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  45.57 
 
 
519 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  47.29 
 
 
509 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  47.29 
 
 
509 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  41.81 
 
 
517 aa  326  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  41.81 
 
 
517 aa  326  6e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  41.68 
 
 
495 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  41.17 
 
 
529 aa  325  9e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  45.98 
 
 
509 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  50.83 
 
 
508 aa  319  6e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  41.01 
 
 
514 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  41.7 
 
 
555 aa  316  7e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  49.89 
 
 
509 aa  316  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  39.57 
 
 
511 aa  315  9e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  45.14 
 
 
515 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  39.95 
 
 
522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  40.14 
 
 
521 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  42.56 
 
 
543 aa  313  4.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  43.6 
 
 
534 aa  311  1e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  38.74 
 
 
524 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  38.74 
 
 
524 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  38.74 
 
 
524 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  39.33 
 
 
511 aa  310  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  38.74 
 
 
524 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  38.74 
 
 
524 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  40.64 
 
 
511 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  40.64 
 
 
511 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  42.3 
 
 
529 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  40.64 
 
 
511 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  39.73 
 
 
526 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  40.64 
 
 
511 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  40.64 
 
 
511 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  39.83 
 
 
515 aa  310  5e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  40.41 
 
 
511 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  40.41 
 
 
511 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  40.41 
 
 
511 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  40.41 
 
 
511 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  39.35 
 
 
528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  39.26 
 
 
511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  39.48 
 
 
511 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  39.48 
 
 
542 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  43.55 
 
 
523 aa  307  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  38.45 
 
 
512 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  40.44 
 
 
498 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  40.85 
 
 
522 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  35.84 
 
 
523 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  36.04 
 
 
523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  39.01 
 
 
520 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  39.14 
 
 
511 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  47.39 
 
 
509 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  38.09 
 
 
523 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  39.27 
 
 
511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  39.48 
 
 
515 aa  303  6.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  44.74 
 
 
535 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  35.8 
 
 
531 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  39.52 
 
 
511 aa  301  2e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  35.59 
 
 
495 aa  301  3e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  38.92 
 
 
522 aa  299  9e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  44.57 
 
 
525 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  38.28 
 
 
511 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  35.28 
 
 
519 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  39.75 
 
 
512 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  37.5 
 
 
508 aa  296  8e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  39.75 
 
 
512 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  42.89 
 
 
511 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  41.76 
 
 
532 aa  295  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  38.48 
 
 
512 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  42.37 
 
 
512 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  35.09 
 
 
519 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  35.09 
 
 
519 aa  293  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  37.45 
 
 
516 aa  291  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  41.67 
 
 
521 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  37.85 
 
 
518 aa  290  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  35.48 
 
 
519 aa  290  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  41.01 
 
 
528 aa  289  7e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  35.86 
 
 
505 aa  289  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  40.32 
 
 
512 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  34.5 
 
 
524 aa  289  9e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  35.87 
 
 
519 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  36.96 
 
 
533 aa  288  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>