More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0011 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0011  integral membrane protein MviN  100 
 
 
518 aa  1022    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0453851  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  40.43 
 
 
514 aa  347  3e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  39.16 
 
 
528 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  37.07 
 
 
529 aa  311  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  42.04 
 
 
512 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  37.69 
 
 
529 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  40.55 
 
 
513 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  41.45 
 
 
513 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  37.26 
 
 
555 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  40.34 
 
 
513 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  35.26 
 
 
520 aa  291  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  40.04 
 
 
543 aa  290  4e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  39.4 
 
 
534 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  38.13 
 
 
514 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  37.5 
 
 
526 aa  279  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  39.56 
 
 
528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  40.7 
 
 
515 aa  272  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  40.42 
 
 
532 aa  269  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  39.59 
 
 
525 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  38.55 
 
 
535 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  36.73 
 
 
522 aa  259  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  40 
 
 
508 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  39.12 
 
 
509 aa  249  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  39.12 
 
 
509 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  40.59 
 
 
510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  36.42 
 
 
513 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  33.12 
 
 
511 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  35.98 
 
 
509 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  32.9 
 
 
511 aa  236  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  33.55 
 
 
511 aa  236  8e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  35.7 
 
 
509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  36.42 
 
 
521 aa  233  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  33.05 
 
 
511 aa  232  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  32.25 
 
 
511 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  30.38 
 
 
495 aa  229  1e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  38.43 
 
 
509 aa  229  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 
524 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 
524 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 
524 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  35.59 
 
 
509 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  33.47 
 
 
518 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 
524 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 
515 aa  228  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 
524 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  34.31 
 
 
519 aa  227  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  35.73 
 
 
534 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
519 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  33.85 
 
 
522 aa  225  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  32.24 
 
 
516 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  32.56 
 
 
511 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  32.56 
 
 
511 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  32.56 
 
 
511 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  32.56 
 
 
511 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  34.75 
 
 
509 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
511 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  32.85 
 
 
512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  32.91 
 
 
512 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  32.17 
 
 
523 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  33.4 
 
 
515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  33.14 
 
 
529 aa  220  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  34.16 
 
 
522 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  34.79 
 
 
508 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  35.92 
 
 
509 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  36.82 
 
 
523 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  30.95 
 
 
511 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  31.58 
 
 
498 aa  217  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  32.69 
 
 
512 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  33.49 
 
 
512 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  32.04 
 
 
519 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  31.35 
 
 
511 aa  216  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  34.11 
 
 
520 aa  216  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  31.8 
 
 
516 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  35.21 
 
 
525 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  31.87 
 
 
511 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  33.61 
 
 
531 aa  212  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  31.51 
 
 
512 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  31.87 
 
 
520 aa  212  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  32.8 
 
 
516 aa  211  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  32.09 
 
 
573 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  34.51 
 
 
517 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  34.51 
 
 
517 aa  210  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  30.8 
 
 
545 aa  210  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  31.55 
 
 
519 aa  210  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  31.97 
 
 
512 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 
530 aa  209  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
522 aa  209  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  39.58 
 
 
509 aa  209  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  34.09 
 
 
513 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  31.29 
 
 
542 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  32.71 
 
 
521 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  30.32 
 
 
530 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  31.64 
 
 
511 aa  208  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  30.54 
 
 
530 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  31.33 
 
 
512 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  31.55 
 
 
519 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  31.04 
 
 
512 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>