More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2400 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  77.93 
 
 		 521 aa  781    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  100 
 
 		 521 aa  1036    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  77.26 
 
 		 522 aa  799    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  69.36 
 
 		 521 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  75.05 
 
 		 522 aa  727    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  76.2 
 
 		 522 aa  763    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  71.4 
 
 		 521 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  51.35 
 
 		 526 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  47.06 
 
 		 528 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  42.45 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  42.48 
 
 		 511 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  44.15 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  41.18 
 
 		 511 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  43.2 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  42 
 
 		 511 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  42.99 
 
 		 530 aa  336  7e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  44 
 
 		 517 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  44 
 
 		 517 aa  334  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  42.89 
 
 		 511 aa  334  3e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  42.48 
 
 		 511 aa  333  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  40.69 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  40.69 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  40.69 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  40.69 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  40.69 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  41.05 
 
 		 511 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  39.54 
 
 		 542 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  326  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  326  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  326  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  326  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  326  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  41.53 
 
 		 511 aa  326  6e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  326  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  40.81 
 
 		 511 aa  326  6e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  41.53 
 
 		 511 aa  326  6e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  326  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  43.58 
 
 		 495 aa  323  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  37.18 
 
 		 525 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  42.96 
 
 		 512 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  43.68 
 
 		 512 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  42.38 
 
 		 512 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  42.38 
 
 		 512 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  42.49 
 
 		 522 aa  316  7e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  36.93 
 
 		 519 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  40.16 
 
 		 512 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  39 
 
 		 522 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  44.87 
 
 		 512 aa  312  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  43.23 
 
 		 498 aa  313  6.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  38.74 
 
 		 518 aa  313  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  38.89 
 
 		 534 aa  312  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  39.8 
 
 		 513 aa  312  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  40.84 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  38.34 
 
 		 519 aa  310  4e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  39.17 
 
 		 523 aa  310  5e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  38.67 
 
 		 517 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  42.24 
 
 		 512 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  40 
 
 		 516 aa  309  6.999999999999999e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  39.14 
 
 		 523 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  42.62 
 
 		 513 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  38.27 
 
 		 523 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  39.52 
 
 		 508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  36.35 
 
 		 519 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  38.88 
 
 		 573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  43.78 
 
 		 516 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  36.35 
 
 		 519 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  39.57 
 
 		 521 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  37.45 
 
 		 530 aa  303  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  35.73 
 
 		 519 aa  302  9e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  39.14 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  39.86 
 
 		 530 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  37.13 
 
 		 516 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  38.25 
 
 		 524 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  37.45 
 
 		 521 aa  300  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  38.02 
 
 		 520 aa  300  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  40.34 
 
 		 511 aa  299  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  42 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  38.67 
 
 		 545 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  42 
 
 		 512 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  36.15 
 
 		 519 aa  296  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  38.8 
 
 		 519 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  37.91 
 
 		 519 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  38.34 
 
 		 519 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  38.34 
 
 		 519 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  38.34 
 
 		 519 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  38.34 
 
 		 519 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  38.34 
 
 		 519 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  37.61 
 
 		 519 aa  292  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  41.77 
 
 		 512 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  39.22 
 
 		 521 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  36.93 
 
 		 523 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  39.96 
 
 		 516 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  37.5 
 
 		 517 aa  286  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  36.44 
 
 		 518 aa  286  5e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  35.11 
 
 		 521 aa  286  5.999999999999999e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  36.44 
 
 		 519 aa  286  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  36.44 
 
 		 531 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  37.91 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  43.26 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  39.51 
 
 		 516 aa  285  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>