More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2158 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  85.29 
 
 		 511 aa  863    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  85.29 
 
 		 511 aa  863    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  72.5 
 
 		 512 aa  746    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  98.63 
 
 		 511 aa  992    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  99.8 
 
 		 511 aa  1004    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  72.41 
 
 		 513 aa  718    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  85.1 
 
 		 511 aa  863    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  84.27 
 
 		 524 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  76.82 
 
 		 512 aa  765    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  76.01 
 
 		 528 aa  747    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  85.1 
 
 		 511 aa  863    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  76.23 
 
 		 512 aa  775    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  85.1 
 
 		 511 aa  863    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  84.27 
 
 		 524 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  84.27 
 
 		 524 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  72.69 
 
 		 512 aa  749    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  85.1 
 
 		 511 aa  863    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  84.27 
 
 		 524 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  78.24 
 
 		 511 aa  797    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  86.47 
 
 		 511 aa  889    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  73.44 
 
 		 514 aa  709    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  89.98 
 
 		 511 aa  905    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  70.22 
 
 		 508 aa  721    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  85.1 
 
 		 511 aa  863    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  72.89 
 
 		 512 aa  736    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  84.27 
 
 		 524 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  84.12 
 
 		 511 aa  860    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  72.89 
 
 		 512 aa  729    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  77.21 
 
 		 512 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  84.51 
 
 		 511 aa  868    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  80.39 
 
 		 511 aa  831    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 542 aa  1075    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  85.29 
 
 		 511 aa  863    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  85.29 
 
 		 511 aa  863    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  77.21 
 
 		 512 aa  748    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  62.87 
 
 		 511 aa  627  1e-178  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  61.55 
 
 		 513 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  64.44 
 
 		 512 aa  591  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  60.7 
 
 		 516 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  62.65 
 
 		 512 aa  554  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  51.63 
 
 		 517 aa  495  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  51.45 
 
 		 530 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  51.15 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  47.4 
 
 		 530 aa  491  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  51.25 
 
 		 530 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  52.41 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5882  virulence factor MVIN-like  54.05 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.480668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  52.99 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1076  integral membrane protein MviN  52.68 
 
 		 606 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.656695  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2513  integral membrane protein MviN  52.68 
 
 		 592 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0678  integral membrane protein MviN  52.68 
 
 		 539 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0736  integral membrane protein MviN  52.49 
 
 		 539 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0924  integral membrane protein MviN  52.68 
 
 		 592 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0127  integral membrane protein MviN  52.68 
 
 		 592 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  52.6 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  50.48 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1938  integral membrane protein MviN  54.02 
 
 		 546 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.919423  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0378  integral membrane protein MviN  52.7 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2574  integral membrane protein MviN  54.05 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0921  integral membrane protein MviN  52.7 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.432333  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2550  integral membrane protein MviN  54.05 
 
 		 516 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2469  integral membrane protein MviN  53.86 
 
 		 516 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0186654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2599  integral membrane protein MviN  53.86 
 
 		 516 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0746  integral membrane protein MviN  53.67 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.533432 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  47.53 
 
 		 517 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  47.53 
 
 		 517 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  49.11 
 
 		 512 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  45.74 
 
 		 518 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  47.6 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  48.57 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  48.69 
 
 		 495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  44.29 
 
 		 523 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  44.29 
 
 		 523 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  45.44 
 
 		 515 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  45.24 
 
 		 515 aa  437  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  45.32 
 
 		 522 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  44.51 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  48.01 
 
 		 517 aa  422  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  48.1 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  46.02 
 
 		 522 aa  422  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  47.33 
 
 		 521 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  43.73 
 
 		 531 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  45.91 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  44.21 
 
 		 573 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  44.99 
 
 		 545 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  44.63 
 
 		 545 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  44.47 
 
 		 533 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  45.72 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  44.31 
 
 		 523 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  45.99 
 
 		 521 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  43.86 
 
 		 519 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  44.53 
 
 		 521 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  42.47 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1838  integral membrane protein MviN  47.65 
 
 		 529 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  43.12 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  42.53 
 
 		 519 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  42.53 
 
 		 519 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  45.87 
 
 		 513 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  42.05 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  44.76 
 
 		 521 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>