More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1436 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  77.01 
 
 		 508 aa  672    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  80.51 
 
 		 509 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  88.8 
 
 		 534 aa  826    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 509 aa  970    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  88.21 
 
 		 509 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  79.33 
 
 		 508 aa  728    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  87.23 
 
 		 509 aa  805    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  56 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  56 
 
 		 509 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  56.53 
 
 		 509 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  57.88 
 
 		 508 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  59 
 
 		 509 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  60.18 
 
 		 509 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  50.4 
 
 		 509 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  53.33 
 
 		 519 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  44.2 
 
 		 512 aa  337  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  49.64 
 
 		 510 aa  323  5e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  42.94 
 
 		 513 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  39.2 
 
 		 522 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  38.65 
 
 		 529 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  38.84 
 
 		 521 aa  290  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  38.86 
 
 		 529 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  41.63 
 
 		 525 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  37.65 
 
 		 529 aa  283  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  34.07 
 
 		 495 aa  283  6.000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  38.14 
 
 		 528 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  37.94 
 
 		 526 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  38.86 
 
 		 555 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  41.2 
 
 		 535 aa  273  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  35.1 
 
 		 520 aa  273  7e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  35.76 
 
 		 517 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  35.76 
 
 		 517 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  38.23 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  38.24 
 
 		 498 aa  266  8e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  37.85 
 
 		 532 aa  266  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  38.94 
 
 		 514 aa  264  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  38.07 
 
 		 515 aa  263  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  37.69 
 
 		 522 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  37.95 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  37.68 
 
 		 511 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  37.31 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  37.31 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  36.26 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  36.97 
 
 		 524 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  36.97 
 
 		 524 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  36.97 
 
 		 524 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  36.97 
 
 		 524 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  36.97 
 
 		 524 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  35.58 
 
 		 518 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  36.02 
 
 		 511 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  37.9 
 
 		 515 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  36.49 
 
 		 511 aa  256  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  36.49 
 
 		 511 aa  256  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  36.49 
 
 		 511 aa  256  9e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  36.49 
 
 		 511 aa  256  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  36.49 
 
 		 511 aa  256  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  36.49 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  36.49 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  39.29 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  36.49 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  36.49 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  37.91 
 
 		 512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  37.91 
 
 		 512 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  35.98 
 
 		 511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  35.53 
 
 		 512 aa  253  6e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  33.47 
 
 		 516 aa  253  6e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  35.4 
 
 		 513 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  37.44 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  35.55 
 
 		 511 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  38.78 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  35.75 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  38.72 
 
 		 512 aa  251  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  34.93 
 
 		 511 aa  251  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  35.56 
 
 		 512 aa  250  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  37.44 
 
 		 512 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  37.05 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  36.38 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  36.04 
 
 		 523 aa  246  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  40.8 
 
 		 528 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  36.73 
 
 		 512 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  38.13 
 
 		 514 aa  246  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  34.65 
 
 		 516 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  33.62 
 
 		 511 aa  243  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  35.07 
 
 		 511 aa  243  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  35.07 
 
 		 542 aa  243  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  40.86 
 
 		 543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  34.26 
 
 		 516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  36.97 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  36.21 
 
 		 513 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  34.78 
 
 		 523 aa  239  9e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  34.99 
 
 		 508 aa  239  9e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  35.04 
 
 		 528 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  34.66 
 
 		 533 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  35.68 
 
 		 523 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  34.85 
 
 		 516 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  38.06 
 
 		 525 aa  234  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  33.53 
 
 		 516 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  37.26 
 
 		 514 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  36.99 
 
 		 528 aa  233  9e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  35.41 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>