More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2272 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  77.3 
 
 
511 aa  796    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  77.3 
 
 
511 aa  796    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  71.04 
 
 
512 aa  735    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  77.1 
 
 
511 aa  796    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  78.24 
 
 
524 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  75.93 
 
 
512 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  76.13 
 
 
528 aa  729    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  77.3 
 
 
511 aa  796    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  84.74 
 
 
511 aa  870    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  73.19 
 
 
512 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  77.1 
 
 
511 aa  796    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  78.24 
 
 
524 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  78.24 
 
 
542 aa  805    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  78.24 
 
 
511 aa  806    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  77.1 
 
 
511 aa  796    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  80.55 
 
 
511 aa  821    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  77.3 
 
 
511 aa  796    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  70.18 
 
 
513 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  79.22 
 
 
511 aa  820    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  77.1 
 
 
511 aa  796    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  68.44 
 
 
508 aa  712    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  77.89 
 
 
511 aa  813    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  71.82 
 
 
512 aa  728    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  77.1 
 
 
511 aa  796    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  71.82 
 
 
512 aa  729    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  78.24 
 
 
524 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  100 
 
 
511 aa  1009    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  84.74 
 
 
511 aa  876    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  78.24 
 
 
524 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  75.73 
 
 
512 aa  743    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  86.11 
 
 
511 aa  880    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  71.04 
 
 
512 aa  734    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  78.24 
 
 
524 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  71.93 
 
 
514 aa  692    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  75.93 
 
 
512 aa  744    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  63.33 
 
 
512 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  60.59 
 
 
511 aa  587  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  60.16 
 
 
513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  59.14 
 
 
516 aa  551  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  61.96 
 
 
512 aa  549  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  48.93 
 
 
530 aa  492  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  47.48 
 
 
518 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5882  virulence factor MVIN-like  50.97 
 
 
516 aa  476  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.480668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  52.95 
 
 
530 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  52.52 
 
 
530 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  52.97 
 
 
517 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  51.25 
 
 
516 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0736  integral membrane protein MviN  51.35 
 
 
539 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  50.48 
 
 
534 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  46.34 
 
 
523 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2574  integral membrane protein MviN  51.45 
 
 
516 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2550  integral membrane protein MviN  51.45 
 
 
516 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2469  integral membrane protein MviN  51.25 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0186654 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0378  integral membrane protein MviN  51.16 
 
 
516 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  45.94 
 
 
523 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  49.62 
 
 
516 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0921  integral membrane protein MviN  51.16 
 
 
516 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.432333  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  47.81 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  47.42 
 
 
515 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0678  integral membrane protein MviN  51.16 
 
 
539 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1938  integral membrane protein MviN  51.35 
 
 
546 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.919423  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2599  integral membrane protein MviN  51.25 
 
 
516 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1076  integral membrane protein MviN  51.16 
 
 
606 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.656695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  47.43 
 
 
512 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  50.58 
 
 
516 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  50.1 
 
 
516 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0127  integral membrane protein MviN  51.16 
 
 
592 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2513  integral membrane protein MviN  51.16 
 
 
592 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0924  integral membrane protein MviN  51.16 
 
 
592 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  47.42 
 
 
515 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  47.34 
 
 
517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  49.24 
 
 
517 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  47.34 
 
 
517 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  47.88 
 
 
495 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  46.6 
 
 
516 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0746  integral membrane protein MviN  51.26 
 
 
516 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.533432 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  45.09 
 
 
522 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  44.85 
 
 
573 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  46.3 
 
 
516 aa  427  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  47.72 
 
 
517 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  45.53 
 
 
516 aa  424  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  43.89 
 
 
545 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  40.89 
 
 
523 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  47.08 
 
 
522 aa  418  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  45.35 
 
 
521 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  42.75 
 
 
533 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1838  integral membrane protein MviN  48.24 
 
 
529 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  46.11 
 
 
521 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  41.03 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  41.95 
 
 
522 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  41.57 
 
 
534 aa  405  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  45.92 
 
 
521 aa  405  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  41.86 
 
 
519 aa  405  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  40.32 
 
 
505 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  47.61 
 
 
521 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  44.27 
 
 
545 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  46.88 
 
 
520 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  46.26 
 
 
513 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  40.86 
 
 
519 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  40.28 
 
 
519 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>