More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1282 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  94.31 
 
 
511 aa  941    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  94.31 
 
 
511 aa  941    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  71.51 
 
 
512 aa  745    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  85.91 
 
 
511 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  94.12 
 
 
511 aa  941    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  74.85 
 
 
512 aa  755    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  100 
 
 
524 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  74.07 
 
 
528 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  78.63 
 
 
511 aa  812    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  100 
 
 
524 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  73.48 
 
 
512 aa  758    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  94.12 
 
 
511 aa  941    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  100 
 
 
524 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  94.12 
 
 
511 aa  941    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  84.93 
 
 
511 aa  871    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  80.98 
 
 
511 aa  837    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  100 
 
 
524 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  84.74 
 
 
511 aa  864    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  91.57 
 
 
511 aa  948    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  71.71 
 
 
512 aa  734    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  94.12 
 
 
511 aa  941    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  84.27 
 
 
542 aa  874    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  94.12 
 
 
511 aa  941    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  69.69 
 
 
508 aa  721    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  71.23 
 
 
513 aa  708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  72.66 
 
 
514 aa  698    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  77.41 
 
 
512 aa  753    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  72.1 
 
 
512 aa  731    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  100 
 
 
524 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  76.03 
 
 
512 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  78.24 
 
 
511 aa  800    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  94.31 
 
 
511 aa  941    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  71.71 
 
 
512 aa  748    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  94.31 
 
 
511 aa  941    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  81.57 
 
 
511 aa  844    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  61.64 
 
 
511 aa  610  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  64.38 
 
 
512 aa  605  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  61.84 
 
 
513 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  63.01 
 
 
512 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  60 
 
 
516 aa  561  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  51.06 
 
 
530 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  50.77 
 
 
516 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  54.3 
 
 
530 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5882  virulence factor MVIN-like  52.82 
 
 
516 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.480668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  52.67 
 
 
516 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  50.49 
 
 
517 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  52.1 
 
 
516 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  52.12 
 
 
516 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  46.97 
 
 
530 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1938  integral membrane protein MviN  52.55 
 
 
546 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.919423  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2574  integral membrane protein MviN  52.87 
 
 
516 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0736  integral membrane protein MviN  51.05 
 
 
539 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  49.43 
 
 
534 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2550  integral membrane protein MviN  52.87 
 
 
516 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2469  integral membrane protein MviN  52.87 
 
 
516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0186654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  46.06 
 
 
523 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  45.87 
 
 
523 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0678  integral membrane protein MviN  51.05 
 
 
539 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1076  integral membrane protein MviN  51.05 
 
 
606 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.656695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  48.42 
 
 
512 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  46.32 
 
 
518 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2513  integral membrane protein MviN  51.05 
 
 
592 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2599  integral membrane protein MviN  52.87 
 
 
516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0127  integral membrane protein MviN  51.05 
 
 
592 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0378  integral membrane protein MviN  51.35 
 
 
516 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  47.35 
 
 
517 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0921  integral membrane protein MviN  51.35 
 
 
516 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.432333  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  47.35 
 
 
517 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  48.69 
 
 
495 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0924  integral membrane protein MviN  51.15 
 
 
592 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  49 
 
 
498 aa  464  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  50.1 
 
 
517 aa  460  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0746  integral membrane protein MviN  51.93 
 
 
516 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.533432 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  45.83 
 
 
515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  46.03 
 
 
515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  45.4 
 
 
516 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  49.53 
 
 
517 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  45.38 
 
 
522 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  47.27 
 
 
520 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  43.69 
 
 
573 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  46.58 
 
 
516 aa  423  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  44.08 
 
 
533 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  46.18 
 
 
516 aa  423  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  46.52 
 
 
521 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  43.17 
 
 
545 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  45.21 
 
 
522 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  42.75 
 
 
523 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  41.11 
 
 
531 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  45.6 
 
 
521 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  42.72 
 
 
519 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  43.33 
 
 
522 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  41.34 
 
 
519 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  41.75 
 
 
525 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  44.63 
 
 
521 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  41.34 
 
 
519 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  43.5 
 
 
545 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  44.26 
 
 
521 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  41.93 
 
 
519 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  44.62 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  41.14 
 
 
519 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>