More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4500 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  77.8 
 
 		 508 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  91.75 
 
 		 534 aa  846    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  87.23 
 
 		 509 aa  803    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  90.96 
 
 		 509 aa  817    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 509 aa  977    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  78.15 
 
 		 508 aa  709    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  80.12 
 
 		 509 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  54.6 
 
 		 509 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  54.6 
 
 		 509 aa  464  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  57.84 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  54.1 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3497  integral membrane protein MviN  59.23 
 
 		 509 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319117  normal  0.680185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5302  integral membrane protein MviN  59.96 
 
 		 509 aa  425  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  50.61 
 
 		 509 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  53.79 
 
 		 519 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  44.84 
 
 		 512 aa  337  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  48.42 
 
 		 510 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  43.54 
 
 		 513 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  39.08 
 
 		 522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  43.45 
 
 		 525 aa  295  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  41.49 
 
 		 529 aa  287  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  39.45 
 
 		 521 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  38.53 
 
 		 529 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  39.7 
 
 		 529 aa  279  7e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  38.14 
 
 		 526 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  34.42 
 
 		 495 aa  274  3e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  37.55 
 
 		 528 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  39.43 
 
 		 498 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  36.44 
 
 		 517 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  36.44 
 
 		 517 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  36.51 
 
 		 530 aa  272  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  38.74 
 
 		 555 aa  272  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  37.01 
 
 		 520 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  36.79 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  40.82 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  35.67 
 
 		 511 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 		 524 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 		 524 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 		 524 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 		 524 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 		 524 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  35.9 
 
 		 511 aa  262  8.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  35.71 
 
 		 515 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  37.87 
 
 		 522 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  34.53 
 
 		 511 aa  260  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  37.25 
 
 		 495 aa  260  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  36.49 
 
 		 511 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  34.32 
 
 		 511 aa  259  7e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  37.95 
 
 		 512 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  33.85 
 
 		 516 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  36.09 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  36.09 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  35.88 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  35.88 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  35.88 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  35.95 
 
 		 518 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  35.88 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  35.88 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  35.78 
 
 		 515 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  35.8 
 
 		 513 aa  256  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  35.42 
 
 		 512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  35.44 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  38.1 
 
 		 532 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  40.68 
 
 		 513 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  37.56 
 
 		 522 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  37.29 
 
 		 512 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  38.96 
 
 		 514 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  39.19 
 
 		 513 aa  253  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  40.68 
 
 		 513 aa  253  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  35.98 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  36.05 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  36.05 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  38.72 
 
 		 512 aa  251  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  36.02 
 
 		 511 aa  250  5e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  36.02 
 
 		 542 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  35.77 
 
 		 511 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  37.25 
 
 		 523 aa  249  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  36.15 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  34.81 
 
 		 516 aa  248  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  37.24 
 
 		 512 aa  247  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  34.56 
 
 		 523 aa  247  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  33.65 
 
 		 516 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  34.68 
 
 		 523 aa  246  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  36.47 
 
 		 512 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  41.23 
 
 		 528 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  37.39 
 
 		 514 aa  243  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  36.24 
 
 		 522 aa  240  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  36.54 
 
 		 522 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 		 508 aa  239  1e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  35.81 
 
 		 512 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  35.92 
 
 		 513 aa  238  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  38.92 
 
 		 514 aa  236  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  36.67 
 
 		 528 aa  236  9e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  40.36 
 
 		 543 aa  236  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  33.73 
 
 		 516 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  38.39 
 
 		 525 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  35.06 
 
 		 518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  34.57 
 
 		 522 aa  234  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>