More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0587 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 523 aa  1026    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  59.89 
 
 		 525 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  46.15 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  41.1 
 
 		 512 aa  343  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  42.8 
 
 		 522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  40.99 
 
 		 514 aa  330  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  44.26 
 
 		 525 aa  324  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  40.56 
 
 		 529 aa  322  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  40.58 
 
 		 513 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  40.58 
 
 		 513 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  40.81 
 
 		 513 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  39.42 
 
 		 511 aa  309  8e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  42.57 
 
 		 532 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  38.49 
 
 		 511 aa  303  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  38.34 
 
 		 511 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  40.37 
 
 		 555 aa  303  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  41.4 
 
 		 511 aa  303  7.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  38.29 
 
 		 528 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  38.34 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  37.47 
 
 		 524 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  37.47 
 
 		 524 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  37.47 
 
 		 524 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  37.47 
 
 		 524 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  37.47 
 
 		 524 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  40.92 
 
 		 528 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2834  putative virulence factor  41.92 
 
 		 534 aa  300  5e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00622591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  37.33 
 
 		 518 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  36.99 
 
 		 520 aa  296  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  40.26 
 
 		 529 aa  296  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  40.38 
 
 		 529 aa  296  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3955  integral membrane protein MviN  40.38 
 
 		 514 aa  296  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.106574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  39.68 
 
 		 513 aa  295  9e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  38.86 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  38.08 
 
 		 511 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 511 aa  295  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  38.08 
 
 		 511 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 511 aa  295  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  40.56 
 
 		 495 aa  294  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  40.34 
 
 		 522 aa  293  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  38.92 
 
 		 528 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  38.07 
 
 		 526 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  38.17 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  38.81 
 
 		 522 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  38.17 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  38.54 
 
 		 512 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  39.95 
 
 		 511 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  38.77 
 
 		 512 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  38.69 
 
 		 512 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  38.46 
 
 		 511 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  38.46 
 
 		 542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  38.9 
 
 		 543 aa  284  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  36.99 
 
 		 512 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  43.35 
 
 		 510 aa  283  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  39.88 
 
 		 528 aa  281  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  41.38 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  39.84 
 
 		 522 aa  280  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  39.64 
 
 		 534 aa  280  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  39.31 
 
 		 513 aa  279  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  39.74 
 
 		 517 aa  277  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  38.7 
 
 		 516 aa  277  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  36.74 
 
 		 508 aa  276  5e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  39.56 
 
 		 517 aa  276  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  38.22 
 
 		 517 aa  276  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  38.22 
 
 		 517 aa  276  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  32.81 
 
 		 495 aa  275  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  41.27 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  38.72 
 
 		 530 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  40.8 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  38.5 
 
 		 530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  38.1 
 
 		 512 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0445  integral membrane protein MviN  37.9 
 
 		 515 aa  272  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  40.23 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  37.81 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  36.24 
 
 		 533 aa  270  5.9999999999999995e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  35.44 
 
 		 520 aa  269  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  38.2 
 
 		 514 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  38.65 
 
 		 530 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  35.48 
 
 		 511 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  38.08 
 
 		 512 aa  264  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  38.78 
 
 		 512 aa  264  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  37.25 
 
 		 509 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  37.31 
 
 		 521 aa  259  6e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  35.49 
 
 		 522 aa  259  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  33.77 
 
 		 531 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  35.07 
 
 		 523 aa  259  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  37.19 
 
 		 515 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  35.88 
 
 		 525 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  34.93 
 
 		 521 aa  257  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  35.04 
 
 		 516 aa  257  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  37.43 
 
 		 509 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  38.05 
 
 		 534 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  40.5 
 
 		 509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  36.8 
 
 		 508 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  35.8 
 
 		 534 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  40.5 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>