More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0712 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 511 aa  991    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  57.26 
 
 		 511 aa  497  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  52.55 
 
 		 528 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0543  integral membrane protein MviN  55.74 
 
 		 527 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  43.69 
 
 		 522 aa  316  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  40.34 
 
 		 521 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  44.79 
 
 		 529 aa  311  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  43.68 
 
 		 526 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  40.6 
 
 		 517 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  40.6 
 
 		 517 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  44.34 
 
 		 522 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  43.61 
 
 		 521 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  41.59 
 
 		 511 aa  298  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  42.69 
 
 		 522 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  41.01 
 
 		 521 aa  297  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  44.57 
 
 		 522 aa  296  5e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  45.23 
 
 		 512 aa  296  7e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  40.47 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  41.59 
 
 		 511 aa  294  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  40.79 
 
 		 518 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  42.86 
 
 		 498 aa  292  9e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  38.46 
 
 		 519 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  40.42 
 
 		 511 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  38.46 
 
 		 519 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  42.7 
 
 		 495 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  39.14 
 
 		 519 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  39.14 
 
 		 519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  39.14 
 
 		 519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  39.14 
 
 		 519 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  42.25 
 
 		 530 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  38.24 
 
 		 519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  39.95 
 
 		 511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  39.02 
 
 		 511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  42.53 
 
 		 521 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  42.86 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  38.46 
 
 		 519 aa  282  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  38.16 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  38.16 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  38.16 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  38.16 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  38.16 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  39.02 
 
 		 511 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  40.64 
 
 		 522 aa  279  7e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  39.02 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  39.02 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  38.79 
 
 		 542 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  39.02 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  39.02 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  39.02 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  39.02 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  39.02 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  38.79 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  39.02 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  39.02 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  41.52 
 
 		 521 aa  278  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  38.37 
 
 		 511 aa  276  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  36.02 
 
 		 520 aa  276  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2453  integral membrane protein MviN  41.89 
 
 		 596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  37.92 
 
 		 519 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  39.21 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  38.58 
 
 		 512 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  40.05 
 
 		 515 aa  274  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  36.96 
 
 		 519 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  38.24 
 
 		 519 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  43.39 
 
 		 522 aa  273  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  40 
 
 		 519 aa  273  7e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  37.14 
 
 		 525 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  37.76 
 
 		 508 aa  271  2e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  37.17 
 
 		 519 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  38.79 
 
 		 518 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  38.5 
 
 		 524 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  36.95 
 
 		 531 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1838  integral membrane protein MviN  45.82 
 
 		 529 aa  269  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  37.96 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  39.53 
 
 		 515 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  38.04 
 
 		 519 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  37.73 
 
 		 523 aa  266  8e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  36.67 
 
 		 519 aa  266  8.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  38.55 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  38.55 
 
 		 512 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  38.08 
 
 		 512 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  38.08 
 
 		 512 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  39.95 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  43.93 
 
 		 512 aa  259  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  35.93 
 
 		 521 aa  259  8e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  41.55 
 
 		 511 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  40.76 
 
 		 512 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  42.13 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  42.65 
 
 		 513 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  36.59 
 
 		 534 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  35.45 
 
 		 523 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  36.83 
 
 		 521 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  39.25 
 
 		 513 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  38.78 
 
 		 573 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  39.49 
 
 		 512 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  37.67 
 
 		 516 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  39.04 
 
 		 533 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  35.81 
 
 		 530 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  35.81 
 
 		 530 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  40.41 
 
 		 512 aa  250  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>