More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1584 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 521 aa  1024    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  43.83 
 
 		 521 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  37.62 
 
 		 531 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  34.76 
 
 		 523 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  35.11 
 
 		 521 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  35.65 
 
 		 522 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  36.06 
 
 		 524 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  35.06 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  32.19 
 
 		 525 aa  259  7e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  36.89 
 
 		 526 aa  258  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  36.17 
 
 		 521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  34.79 
 
 		 529 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  36.64 
 
 		 521 aa  253  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  35.28 
 
 		 521 aa  252  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  34.35 
 
 		 522 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  32.59 
 
 		 514 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  35.36 
 
 		 521 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  34.75 
 
 		 528 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  29.35 
 
 		 521 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 514 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  34.03 
 
 		 522 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  31.32 
 
 		 534 aa  233  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  32.68 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  28.46 
 
 		 523 aa  226  6e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  31.1 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  29.62 
 
 		 539 aa  222  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  32.48 
 
 		 613 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  31.25 
 
 		 495 aa  220  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  32.95 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  27.82 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  33 
 
 		 516 aa  216  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  34.4 
 
 		 535 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  31.53 
 
 		 494 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 		 520 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  33.65 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  34.17 
 
 		 535 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  32.68 
 
 		 541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  33.94 
 
 		 535 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  32.39 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  33.41 
 
 		 512 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  34.5 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  33.03 
 
 		 530 aa  212  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 556 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  31.91 
 
 		 530 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  32.45 
 
 		 512 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  31.44 
 
 		 530 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  32.78 
 
 		 517 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  32.78 
 
 		 517 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  29.55 
 
 		 534 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  33.18 
 
 		 573 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  30.71 
 
 		 528 aa  205  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  34.21 
 
 		 495 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 		 517 aa  203  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  29.52 
 
 		 523 aa  202  9e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  27.12 
 
 		 518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  29.75 
 
 		 523 aa  201  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  32.96 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  30.21 
 
 		 515 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  33.18 
 
 		 521 aa  197  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  32.89 
 
 		 519 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3077  integral membrane protein MviN  36.22 
 
 		 543 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112933  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  31.26 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  31.91 
 
 		 498 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  31.6 
 
 		 521 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  31.9 
 
 		 512 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  33.5 
 
 		 522 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  31.6 
 
 		 532 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 		 548 aa  193  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  29.15 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  31.66 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  32.85 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  32.68 
 
 		 545 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  30.88 
 
 		 513 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  31.66 
 
 		 511 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  30.55 
 
 		 518 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  31.99 
 
 		 522 aa  189  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  32.95 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  29.38 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  29.38 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  29.38 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  29.38 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  29.38 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  31.47 
 
 		 517 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  31.45 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0342  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 		 537 aa  187  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  29.62 
 
 		 517 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 		 511 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  30.8 
 
 		 512 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  28.63 
 
 		 511 aa  187  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  29.12 
 
 		 511 aa  187  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3967  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 		 540 aa  187  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  32.03 
 
 		 511 aa  186  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  29.12 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  29.12 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  28.35 
 
 		 514 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  29.12 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  29.12 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>