More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0885 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  100 
 
 
518 aa  1025    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  40.47 
 
 
523 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  31.21 
 
 
512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  33.48 
 
 
521 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  28.98 
 
 
514 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 
521 aa  211  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 
523 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 
524 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 
526 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  27.98 
 
 
556 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  24.51 
 
 
533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  26.68 
 
 
515 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  25.1 
 
 
514 aa  170  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  25.69 
 
 
531 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  24.62 
 
 
534 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  28.87 
 
 
494 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  28.71 
 
 
511 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 
511 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 
511 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  28.71 
 
 
511 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 
511 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 
511 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 
511 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 
511 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  28.71 
 
 
511 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
521 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 
511 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0122  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.43 
 
 
496 aa  160  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000511918  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  25.6 
 
 
522 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 
524 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 
524 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 
524 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 
524 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 
524 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  23.96 
 
 
521 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  26.12 
 
 
511 aa  156  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  26.61 
 
 
511 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 
495 aa  155  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  26.16 
 
 
511 aa  154  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  26.2 
 
 
521 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  27.29 
 
 
511 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  27.79 
 
 
494 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  25.82 
 
 
511 aa  152  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  26.34 
 
 
505 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  26.2 
 
 
498 aa  151  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  25.79 
 
 
517 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  25.79 
 
 
517 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  26.8 
 
 
529 aa  150  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  27.06 
 
 
511 aa  150  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4951  MVIN-like virulence factor  29.52 
 
 
490 aa  150  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00259183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 
522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  26.59 
 
 
511 aa  148  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  26.59 
 
 
542 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  25.29 
 
 
512 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 
521 aa  148  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  25.76 
 
 
512 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  25.77 
 
 
508 aa  147  7.0000000000000006e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  26 
 
 
512 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  25.41 
 
 
512 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  25.35 
 
 
513 aa  144  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  24.36 
 
 
512 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  25.41 
 
 
512 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  27.52 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  27.59 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  25 
 
 
506 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  25.39 
 
 
528 aa  141  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5561  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 
492 aa  140  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  25.89 
 
 
539 aa  140  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  25.16 
 
 
512 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  24.31 
 
 
517 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  24.3 
 
 
522 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  23.95 
 
 
530 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  29.81 
 
 
537 aa  139  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  25.97 
 
 
533 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  23.43 
 
 
526 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  23.52 
 
 
534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  26.86 
 
 
519 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  24.38 
 
 
525 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  24.21 
 
 
526 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  24.07 
 
 
530 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  24.77 
 
 
512 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  25.39 
 
 
521 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  26.4 
 
 
514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  25.75 
 
 
613 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  24.85 
 
 
523 aa  134  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  25.38 
 
 
516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  26.06 
 
 
528 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  24.79 
 
 
519 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  24.85 
 
 
523 aa  133  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3119  integral membrane protein MviN  23.58 
 
 
507 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  25 
 
 
517 aa  133  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  23.99 
 
 
514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  24.66 
 
 
495 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  23.71 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  26.2 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  25.5 
 
 
548 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1273  integral membrane protein MviN  25.29 
 
 
507 aa  131  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  24.58 
 
 
519 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  21.41 
 
 
530 aa  130  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  25.93 
 
 
523 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>