More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0122 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0122  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  100 
 
 		 496 aa  980    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000511918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  29.09 
 
 		 514 aa  236  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  28.84 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  31.55 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29.36 
 
 		 523 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  32.3 
 
 		 526 aa  195  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  32.43 
 
 		 524 aa  193  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 		 521 aa  183  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  26.22 
 
 		 512 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  31.33 
 
 		 556 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  29.64 
 
 		 533 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  25.34 
 
 		 521 aa  167  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  27.33 
 
 		 521 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  29.2 
 
 		 495 aa  160  4e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  28.17 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.36 
 
 		 534 aa  157  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  28.19 
 
 		 529 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  28.33 
 
 		 494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  28.44 
 
 		 535 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  27.64 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  28.74 
 
 		 535 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  28.21 
 
 		 535 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  27.82 
 
 		 531 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.71 
 
 		 524 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.71 
 
 		 524 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.71 
 
 		 524 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.71 
 
 		 524 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.71 
 
 		 524 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 		 541 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  28.37 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  26.74 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.14 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  29.02 
 
 		 573 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  28.01 
 
 		 537 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  27.1 
 
 		 515 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  25.99 
 
 		 515 aa  142  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0132262 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  25.17 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  26.95 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  25.39 
 
 		 534 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  25.17 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  26.87 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  26.9 
 
 		 530 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  26.4 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  27.18 
 
 		 534 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  27.34 
 
 		 512 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  25.11 
 
 		 539 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  28.03 
 
 		 521 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  26.89 
 
 		 523 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  27.02 
 
 		 513 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  28.3 
 
 		 521 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  27.01 
 
 		 516 aa  140  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  26.37 
 
 		 523 aa  140  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  25.57 
 
 		 511 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  26.17 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  25.43 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  25.59 
 
 		 520 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  26.71 
 
 		 526 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5561  integral membrane protein MviN  26.07 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  26.17 
 
 		 512 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  26.67 
 
 		 530 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  27.48 
 
 		 524 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  30.28 
 
 		 521 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  26.76 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  25.87 
 
 		 528 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  24.07 
 
 		 511 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  25.22 
 
 		 512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4951  MVIN-like virulence factor  25.56 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00259183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  26.05 
 
 		 506 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  25.87 
 
 		 513 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 545 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  27.05 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  23.5 
 
 		 505 aa  134  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  23.6 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  27.1 
 
 		 512 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1590  integral membrane protein MviN  28.21 
 
 		 521 aa  134  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.814029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  27.01 
 
 		 518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  23.6 
 
 		 511 aa  133  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  24.48 
 
 		 511 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 		 521 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  26.89 
 
 		 522 aa  133  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  26.97 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  27.02 
 
 		 512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  25.84 
 
 		 545 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  24.09 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  25.67 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  23.66 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  25.67 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  24.24 
 
 		 542 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  25.55 
 
 		 530 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  23.6 
 
 		 508 aa  130  5.0000000000000004e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>