More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1684 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  100 
 
 
556 aa  1061    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  40.45 
 
 
514 aa  359  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  38.39 
 
 
521 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  39.71 
 
 
521 aa  293  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  44.28 
 
 
526 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  34.83 
 
 
523 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  39.44 
 
 
524 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  37.52 
 
 
533 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  32.65 
 
 
521 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  36.75 
 
 
522 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  35.28 
 
 
521 aa  270  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  31.03 
 
 
523 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  30.19 
 
 
515 aa  266  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  37.63 
 
 
521 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  30.26 
 
 
512 aa  261  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  34.38 
 
 
534 aa  249  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  35.02 
 
 
531 aa  241  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  38.55 
 
 
521 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  34.51 
 
 
522 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  36.72 
 
 
522 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  31.31 
 
 
494 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  34.03 
 
 
528 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  34.43 
 
 
529 aa  217  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  35 
 
 
522 aa  214  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  35.98 
 
 
521 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  34.65 
 
 
528 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  31.31 
 
 
525 aa  212  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  34.42 
 
 
514 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  29.37 
 
 
495 aa  209  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  34.09 
 
 
521 aa  206  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  33.59 
 
 
518 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 
518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  33.73 
 
 
530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0122  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  30.85 
 
 
496 aa  201  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000511918  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  34.77 
 
 
516 aa  200  7e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  29.89 
 
 
526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  31.6 
 
 
511 aa  198  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  35.2 
 
 
512 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  34.03 
 
 
512 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  36.06 
 
 
519 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  34.84 
 
 
535 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 
517 aa  194  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  32.49 
 
 
512 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  32.49 
 
 
512 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  33.1 
 
 
511 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  34.31 
 
 
535 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  34.54 
 
 
535 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  33.72 
 
 
513 aa  189  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  34.38 
 
 
517 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  34.38 
 
 
517 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  33.9 
 
 
548 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  31.85 
 
 
508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  30.91 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  32.55 
 
 
512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  30.91 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  30.91 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  30.91 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  30.91 
 
 
524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  30.52 
 
 
511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  31.25 
 
 
511 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  34.48 
 
 
522 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  30.91 
 
 
511 aa  184  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  30.61 
 
 
511 aa  183  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  30.61 
 
 
511 aa  183  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  30.61 
 
 
511 aa  183  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  30.61 
 
 
511 aa  183  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  30.61 
 
 
511 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  30.61 
 
 
511 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  30.61 
 
 
511 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  30.61 
 
 
511 aa  182  9.000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  30.61 
 
 
511 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  33.27 
 
 
512 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  30.61 
 
 
511 aa  181  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  30.42 
 
 
519 aa  179  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  33.04 
 
 
495 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  33.04 
 
 
613 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  29.76 
 
 
519 aa  179  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  29.68 
 
 
524 aa  177  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  29.38 
 
 
523 aa  176  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  33.26 
 
 
512 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  30.8 
 
 
501 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  32.39 
 
 
541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  32.79 
 
 
512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  28.36 
 
 
519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 
511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  32.02 
 
 
513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 
513 aa  174  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  31.79 
 
 
513 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  32.95 
 
 
521 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  33.1 
 
 
512 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  30.23 
 
 
521 aa  171  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 
515 aa  171  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  33.1 
 
 
528 aa  171  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  25.92 
 
 
506 aa  171  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 
542 aa  170  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  30.59 
 
 
516 aa  170  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  30.82 
 
 
516 aa  169  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 
511 aa  169  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  29.17 
 
 
519 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  29.55 
 
 
519 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>