More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1274 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  100 
 
 
506 aa  988    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1273  integral membrane protein MviN  50.3 
 
 
507 aa  481  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1370  integral membrane protein MviN  46.49 
 
 
512 aa  427  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000411577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  30 
 
 
512 aa  212  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  28.5 
 
 
514 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  27.64 
 
 
522 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 
534 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  26.4 
 
 
528 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  26.15 
 
 
521 aa  161  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  25.72 
 
 
523 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  25 
 
 
526 aa  154  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  26.73 
 
 
521 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  24.83 
 
 
535 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  23.68 
 
 
524 aa  151  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  25.87 
 
 
515 aa  151  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  24.83 
 
 
535 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  25.64 
 
 
515 aa  150  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  25.05 
 
 
523 aa  148  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  24.89 
 
 
535 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  27.29 
 
 
537 aa  146  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  25.35 
 
 
521 aa  145  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 
522 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 
521 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  24.4 
 
 
517 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  24.4 
 
 
517 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  24.46 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  27.29 
 
 
505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 
514 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  24.5 
 
 
519 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  24.8 
 
 
518 aa  139  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  23.5 
 
 
511 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  25.46 
 
 
519 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  27.78 
 
 
521 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  26.39 
 
 
495 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  26 
 
 
523 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  24.71 
 
 
519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  24.7 
 
 
521 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 
521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  25.83 
 
 
511 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0122  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  26.03 
 
 
496 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000511918  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  25.34 
 
 
494 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  25 
 
 
512 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  24.52 
 
 
531 aa  133  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  25.18 
 
 
525 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  23.98 
 
 
519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  25.24 
 
 
512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  23.54 
 
 
541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  26.51 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  24.34 
 
 
521 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  23.89 
 
 
526 aa  131  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  25.24 
 
 
512 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  24.82 
 
 
530 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  24.21 
 
 
521 aa  131  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  25.26 
 
 
556 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  23.7 
 
 
519 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0342  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 
537 aa  130  7.000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0314  integral membrane protein MviN  21.68 
 
 
562 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  24.47 
 
 
511 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  23.61 
 
 
524 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  24.76 
 
 
512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  23.46 
 
 
519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  24.64 
 
 
516 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  23.76 
 
 
519 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  22.87 
 
 
519 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  23.58 
 
 
519 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 
534 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  25.64 
 
 
512 aa  127  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  23.58 
 
 
519 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  23.58 
 
 
519 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  23.58 
 
 
519 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  24.94 
 
 
520 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  22.85 
 
 
511 aa  127  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  23.43 
 
 
533 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  21.56 
 
 
511 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  25.05 
 
 
523 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  24.41 
 
 
523 aa  125  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  23.32 
 
 
522 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  22.8 
 
 
613 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  25.94 
 
 
508 aa  125  3e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  23.6 
 
 
521 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  24.56 
 
 
529 aa  124  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  23.7 
 
 
519 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  21.33 
 
 
511 aa  123  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  22.99 
 
 
519 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  25.17 
 
 
520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  23.06 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1651  integral membrane protein MviN  25.19 
 
 
509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.330651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  24.54 
 
 
514 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  21.77 
 
 
511 aa  120  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  24.88 
 
 
522 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  24.29 
 
 
519 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  25.2 
 
 
512 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  24.13 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  23.96 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  23.7 
 
 
519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  22.27 
 
 
511 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  24.44 
 
 
509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  23.58 
 
 
530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4951  MVIN-like virulence factor  25.49 
 
 
490 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00259183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>