More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1370 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1370  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 512 aa  1006    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000411577  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1273  integral membrane protein MviN  50.59 
 
 		 507 aa  481  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  46.49 
 
 		 506 aa  456  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  30.72 
 
 		 512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  29.14 
 
 		 514 aa  210  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  31.13 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.86 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  27.98 
 
 		 523 aa  180  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  25.59 
 
 		 521 aa  178  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  26.26 
 
 		 521 aa  170  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  27.7 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  26.11 
 
 		 526 aa  167  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 		 524 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  27.97 
 
 		 522 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  27.74 
 
 		 521 aa  163  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  27.4 
 
 		 501 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  24.37 
 
 		 523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  28.38 
 
 		 505 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  26.92 
 
 		 529 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  28.3 
 
 		 519 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  27.01 
 
 		 531 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  26.57 
 
 		 522 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  26.61 
 
 		 514 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  25.5 
 
 		 535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  25.59 
 
 		 526 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  25.43 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  25.92 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 		 525 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  25.69 
 
 		 535 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  24.4 
 
 		 495 aa  146  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  22.63 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 		 528 aa  146  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  27.25 
 
 		 529 aa  143  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  24.36 
 
 		 511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  26.79 
 
 		 521 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1166  integral membrane protein MviN  27.65 
 
 		 520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  26.22 
 
 		 519 aa  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  25.67 
 
 		 512 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 		 519 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  25.67 
 
 		 512 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 		 521 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 511 aa  140  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  26.26 
 
 		 524 aa  140  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  27.35 
 
 		 519 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  24.83 
 
 		 522 aa  140  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  26.92 
 
 		 555 aa  140  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2723  integral membrane protein MviN  28.49 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793041  normal  0.029084 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  27.78 
 
 		 519 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  27.14 
 
 		 519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 		 522 aa  137  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  25.18 
 
 		 512 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  24.94 
 
 		 521 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  25.59 
 
 		 528 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  27.13 
 
 		 523 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  25.11 
 
 		 613 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  27.98 
 
 		 512 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  23.52 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  24.7 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  23.15 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  25.7 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  26.72 
 
 		 529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  25.11 
 
 		 541 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  27.56 
 
 		 519 aa  133  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  23.85 
 
 		 513 aa  133  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  23.03 
 
 		 511 aa  133  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  24.21 
 
 		 511 aa  133  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  24.23 
 
 		 512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  27 
 
 		 538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  26.14 
 
 		 511 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  26.6 
 
 		 519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  27.51 
 
 		 521 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  27.14 
 
 		 519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  24.88 
 
 		 512 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  24.63 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  23.88 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  25 
 
 		 556 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  27.02 
 
 		 522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  28.65 
 
 		 517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  24.41 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  24.63 
 
 		 513 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 		 519 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  24.72 
 
 		 518 aa  131  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  25.51 
 
 		 494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  24.74 
 
 		 513 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  24.07 
 
 		 530 aa  130  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  26.36 
 
 		 519 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 		 519 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  25.96 
 
 		 497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  25.65 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  23.75 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  25.11 
 
 		 533 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 517 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  24.75 
 
 		 518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  25 
 
 		 537 aa  127  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  23.63 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>