More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0132 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 528 aa  1008    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  87.91 
 
 		 519 aa  818    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  54.21 
 
 		 517 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0452  integral membrane protein MviN  42.86 
 
 		 526 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  32.31 
 
 		 523 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  33.55 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  33.06 
 
 		 521 aa  219  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  31.03 
 
 		 521 aa  216  8e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  35 
 
 		 524 aa  208  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  36.47 
 
 		 529 aa  206  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  38.24 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3077  integral membrane protein MviN  38.38 
 
 		 543 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112933  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  30.22 
 
 		 526 aa  200  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  31.91 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  34.19 
 
 		 521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  36.88 
 
 		 521 aa  196  7e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  32.13 
 
 		 522 aa  196  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  35.49 
 
 		 522 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  32.61 
 
 		 521 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  32.44 
 
 		 521 aa  193  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  33.47 
 
 		 521 aa  193  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  35.41 
 
 		 526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  29.39 
 
 		 519 aa  190  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 		 514 aa  189  9e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  28.97 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  28.95 
 
 		 525 aa  187  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  30.37 
 
 		 519 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  30.37 
 
 		 519 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  30.37 
 
 		 519 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  30.37 
 
 		 519 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  32.01 
 
 		 511 aa  186  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  29.58 
 
 		 519 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  29.58 
 
 		 519 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  32.86 
 
 		 528 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  29.95 
 
 		 519 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  33.94 
 
 		 521 aa  181  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 530 aa  181  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  29.71 
 
 		 519 aa  180  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  30.77 
 
 		 534 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  30.78 
 
 		 534 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 		 524 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  29.95 
 
 		 521 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  27.84 
 
 		 514 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  28.77 
 
 		 519 aa  178  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  29.58 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 556 aa  177  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  34.11 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  34.11 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  30.37 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  32.01 
 
 		 573 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  30.44 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  29.22 
 
 		 534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  30.37 
 
 		 511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  35.06 
 
 		 511 aa  174  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  28.88 
 
 		 511 aa  173  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  33.69 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  31.05 
 
 		 533 aa  173  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  29.51 
 
 		 511 aa  173  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  29.58 
 
 		 519 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  33.42 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  28.9 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  33.42 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 		 519 aa  171  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  32.62 
 
 		 513 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  30.2 
 
 		 539 aa  171  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 		 516 aa  170  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 		 511 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3190  integral membrane protein MviN  34.25 
 
 		 599 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000159661  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  32.6 
 
 		 520 aa  169  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  29.55 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  29.83 
 
 		 511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  29.65 
 
 		 517 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  29.98 
 
 		 505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  31.41 
 
 		 515 aa  168  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  32.24 
 
 		 522 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  29.72 
 
 		 519 aa  167  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  32.05 
 
 		 495 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  33.69 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  30.49 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  29.91 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  31.24 
 
 		 523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  34.79 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  30.15 
 
 		 542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  29.91 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  29.91 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  31.64 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  29.91 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  29.81 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  29.91 
 
 		 524 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  34.96 
 
 		 536 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  29.16 
 
 		 518 aa  164  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  31.31 
 
 		 523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  29.71 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  32.11 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  32.23 
 
 		 545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  29.44 
 
 		 511 aa  163  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  33.86 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>