More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3339 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  71.79 
 
 		 521 aa  716    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  68.59 
 
 		 521 aa  659    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  75.05 
 
 		 521 aa  799    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  76.44 
 
 		 522 aa  795    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  93.1 
 
 		 522 aa  934    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 522 aa  1039    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  70.06 
 
 		 521 aa  712    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  51.64 
 
 		 526 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  47.23 
 
 		 528 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  42.91 
 
 		 529 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  40.77 
 
 		 511 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  39.96 
 
 		 524 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  41.3 
 
 		 511 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  39.96 
 
 		 524 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  39.96 
 
 		 524 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  39.96 
 
 		 524 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  41.07 
 
 		 511 aa  351  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  39.96 
 
 		 524 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  42 
 
 		 511 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  43.74 
 
 		 517 aa  349  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  43.74 
 
 		 517 aa  349  9e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  42.23 
 
 		 511 aa  346  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  41.76 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  41.76 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  41.76 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  41.76 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  343  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 511 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  42.99 
 
 		 530 aa  342  8e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  41.07 
 
 		 511 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  39.24 
 
 		 511 aa  339  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  38.92 
 
 		 542 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  39.35 
 
 		 511 aa  335  9e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  42.82 
 
 		 513 aa  326  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  42.23 
 
 		 512 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  40.37 
 
 		 512 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  40.37 
 
 		 512 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  42 
 
 		 512 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  42.23 
 
 		 512 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  43.3 
 
 		 495 aa  322  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  40.47 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  38.45 
 
 		 516 aa  320  5e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  41.03 
 
 		 522 aa  319  9e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  44.57 
 
 		 511 aa  318  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  39.01 
 
 		 522 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  43.44 
 
 		 511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  39.1 
 
 		 512 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  39.1 
 
 		 521 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  39.08 
 
 		 534 aa  312  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  36.94 
 
 		 517 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  35.38 
 
 		 525 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  39.87 
 
 		 512 aa  310  4e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  39.12 
 
 		 508 aa  309  8e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  37.64 
 
 		 519 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  38.53 
 
 		 518 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  38.71 
 
 		 523 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  38.94 
 
 		 523 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  40.49 
 
 		 511 aa  306  6e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  38.55 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  36.59 
 
 		 530 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  37.36 
 
 		 519 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  35.54 
 
 		 519 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  35.54 
 
 		 519 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  41.53 
 
 		 512 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  39.86 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  41.94 
 
 		 516 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  38.2 
 
 		 573 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  36.17 
 
 		 519 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  37.74 
 
 		 511 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  38.54 
 
 		 512 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  37.84 
 
 		 530 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  37.41 
 
 		 524 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  37.88 
 
 		 519 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  37.88 
 
 		 519 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  37.88 
 
 		 519 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  37.64 
 
 		 519 aa  299  8e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  37.33 
 
 		 523 aa  299  8e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  40.84 
 
 		 512 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  35.54 
 
 		 519 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  34.12 
 
 		 520 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  36.26 
 
 		 519 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  37.41 
 
 		 519 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  37.18 
 
 		 519 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  37.97 
 
 		 523 aa  294  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  36.4 
 
 		 515 aa  293  4e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  37.09 
 
 		 505 aa  293  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  38.95 
 
 		 528 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  34.5 
 
 		 534 aa  293  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  40 
 
 		 516 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  39.77 
 
 		 516 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  40.94 
 
 		 522 aa  292  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  37.58 
 
 		 545 aa  292  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  36.4 
 
 		 515 aa  290  4e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  42.92 
 
 		 512 aa  289  7e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  37.74 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  37.61 
 
 		 532 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  35.03 
 
 		 519 aa  287  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>