More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0761 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  100 
 
 
495 aa  948    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  57.87 
 
 
494 aa  559  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  33.27 
 
 
524 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  32.32 
 
 
505 aa  225  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  32.21 
 
 
498 aa  223  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  33.65 
 
 
511 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 
521 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  30.96 
 
 
521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  32.61 
 
 
519 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  31.86 
 
 
520 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  31.19 
 
 
522 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 
519 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  32.71 
 
 
519 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  33.49 
 
 
525 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  31.5 
 
 
512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  30.75 
 
 
523 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  31.1 
 
 
519 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  31.98 
 
 
519 aa  213  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  32.52 
 
 
523 aa  212  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  31.79 
 
 
519 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  32.95 
 
 
519 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  32.71 
 
 
519 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  32.71 
 
 
519 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  32.71 
 
 
519 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  31.46 
 
 
523 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  30.89 
 
 
519 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  33.02 
 
 
519 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  30.89 
 
 
523 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  31.05 
 
 
523 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  31.1 
 
 
519 aa  206  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  29.18 
 
 
530 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  31.8 
 
 
518 aa  204  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  32.29 
 
 
531 aa  203  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  30.79 
 
 
521 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  32.25 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  28.78 
 
 
533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  30.9 
 
 
521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  28.94 
 
 
530 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  30.93 
 
 
519 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  29.89 
 
 
516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  27.53 
 
 
517 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  29.26 
 
 
515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  29.95 
 
 
521 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  31.58 
 
 
534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  27.97 
 
 
495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  29.56 
 
 
530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  29.01 
 
 
534 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  29.76 
 
 
524 aa  196  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  28.07 
 
 
516 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  32.24 
 
 
514 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  28.91 
 
 
512 aa  194  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  27.59 
 
 
521 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  29.26 
 
 
515 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  30.99 
 
 
528 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  26.92 
 
 
517 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  27.64 
 
 
514 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  28.15 
 
 
545 aa  193  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 
526 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  32.22 
 
 
526 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  30.96 
 
 
529 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  31.72 
 
 
516 aa  191  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 
518 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  30.7 
 
 
521 aa  190  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  31.72 
 
 
516 aa  189  9e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  29.04 
 
 
535 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  28.81 
 
 
535 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  30.99 
 
 
515 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  28.77 
 
 
522 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  28.97 
 
 
521 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  30.91 
 
 
511 aa  186  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  29.04 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 
497 aa  184  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  30.13 
 
 
534 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  26.26 
 
 
516 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
535 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  27.82 
 
 
516 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  25.73 
 
 
516 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  27.75 
 
 
517 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  29.95 
 
 
556 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  27.6 
 
 
512 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  27.75 
 
 
517 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  26.29 
 
 
573 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 
511 aa  182  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  27.67 
 
 
512 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  27.49 
 
 
521 aa  180  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  29.84 
 
 
533 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  29.77 
 
 
522 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0342  integral membrane protein MviN  31.26 
 
 
537 aa  179  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  27.73 
 
 
512 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 
524 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  27.67 
 
 
512 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  27.73 
 
 
512 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  28.69 
 
 
613 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  25.61 
 
 
521 aa  177  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  27.01 
 
 
521 aa  176  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  27.01 
 
 
532 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  29.57 
 
 
521 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 
513 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  25.61 
 
 
520 aa  176  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  23.8 
 
 
545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>