More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2088 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 526 aa  1004    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  52.98 
 
 		 523 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  57.82 
 
 		 524 aa  513  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  53.43 
 
 		 521 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  49.65 
 
 		 533 aa  342  7e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  36.67 
 
 		 534 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  40.24 
 
 		 522 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  35.54 
 
 		 514 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  38 
 
 		 521 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  35.29 
 
 		 521 aa  289  9e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  37.59 
 
 		 521 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  38.82 
 
 		 528 aa  282  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  42.66 
 
 		 556 aa  273  8.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  36.51 
 
 		 529 aa  270  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  38.94 
 
 		 521 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  39.39 
 
 		 512 aa  264  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  37.09 
 
 		 515 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  39.11 
 
 		 530 aa  260  5.0000000000000005e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 		 523 aa  259  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  37.37 
 
 		 522 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  36.56 
 
 		 518 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  37.09 
 
 		 515 aa  257  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  40.45 
 
 		 521 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  36.1 
 
 		 526 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  36.98 
 
 		 511 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  37.3 
 
 		 521 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  39.1 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  37.77 
 
 		 495 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  35.33 
 
 		 511 aa  250  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  37.7 
 
 		 517 aa  249  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  32.83 
 
 		 531 aa  249  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  36.64 
 
 		 524 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  36.64 
 
 		 524 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  36.64 
 
 		 524 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  36.64 
 
 		 524 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  37.15 
 
 		 522 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  36.64 
 
 		 524 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  36.75 
 
 		 512 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  34.65 
 
 		 511 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  37.91 
 
 		 512 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  35.47 
 
 		 534 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  38.3 
 
 		 530 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  35.78 
 
 		 522 aa  243  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  36.3 
 
 		 522 aa  243  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  35.45 
 
 		 517 aa  243  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  35.45 
 
 		 517 aa  243  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  35.46 
 
 		 511 aa  242  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  38.49 
 
 		 521 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  29.42 
 
 		 512 aa  240  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  33.67 
 
 		 511 aa  240  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  34.92 
 
 		 523 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  36.72 
 
 		 521 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  37.61 
 
 		 530 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  35.24 
 
 		 511 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  35.24 
 
 		 511 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  35.24 
 
 		 511 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  35.24 
 
 		 511 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  37.98 
 
 		 512 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  34.62 
 
 		 524 aa  239  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  37.98 
 
 		 512 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  35.01 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  35.01 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  33.27 
 
 		 525 aa  239  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  38.22 
 
 		 512 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  35.01 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  35.01 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  35.01 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  34.56 
 
 		 519 aa  238  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  36.02 
 
 		 533 aa  237  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  33.12 
 
 		 516 aa  237  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  33.26 
 
 		 523 aa  237  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  32.26 
 
 		 508 aa  237  4e-61  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  33.33 
 
 		 523 aa  236  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  37.36 
 
 		 512 aa  236  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  35.93 
 
 		 511 aa  236  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  35.19 
 
 		 511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  36.88 
 
 		 522 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  34.42 
 
 		 511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  35.97 
 
 		 516 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  36.14 
 
 		 498 aa  234  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  38.07 
 
 		 512 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  35.63 
 
 		 512 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 519 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  38.2 
 
 		 516 aa  233  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  34.56 
 
 		 519 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  36.32 
 
 		 573 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  34.19 
 
 		 542 aa  230  4e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  34.19 
 
 		 511 aa  230  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  36.77 
 
 		 521 aa  230  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  37.31 
 
 		 521 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  32.81 
 
 		 505 aa  230  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 		 494 aa  229  9e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  34.79 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  37.84 
 
 		 512 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  33.18 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 519 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 519 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  36.67 
 
 		 545 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 519 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>