More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0565 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  100 
 
 
534 aa  1045    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  33.53 
 
 
523 aa  302  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  38 
 
 
524 aa  292  9e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  34.56 
 
 
521 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  38.03 
 
 
526 aa  274  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  35.09 
 
 
521 aa  266  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  31.59 
 
 
521 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  34.79 
 
 
522 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  37.62 
 
 
514 aa  263  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  36.67 
 
 
523 aa  263  4.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  33.91 
 
 
522 aa  257  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  37.02 
 
 
528 aa  256  6e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  34.5 
 
 
522 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  35.94 
 
 
521 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 
522 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  31.32 
 
 
521 aa  233  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  35.57 
 
 
522 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  32.24 
 
 
512 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  33.01 
 
 
533 aa  228  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  33.08 
 
 
529 aa  228  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  32.08 
 
 
526 aa  227  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  36.71 
 
 
526 aa  224  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  32.24 
 
 
521 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  31.84 
 
 
523 aa  220  5e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  34.53 
 
 
513 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  31.84 
 
 
523 aa  217  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  30.13 
 
 
515 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  34.55 
 
 
556 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 
521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  32.86 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  33.49 
 
 
518 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  32.15 
 
 
511 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  32.39 
 
 
511 aa  209  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  30.28 
 
 
508 aa  209  1e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  34.2 
 
 
513 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  34.69 
 
 
495 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  32.85 
 
 
524 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  32.85 
 
 
524 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  32.85 
 
 
524 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  32.85 
 
 
524 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  32.85 
 
 
524 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  31.15 
 
 
516 aa  206  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  32.63 
 
 
530 aa  206  9e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  30.95 
 
 
494 aa  206  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  32.25 
 
 
521 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  31.44 
 
 
511 aa  205  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  31.54 
 
 
515 aa  204  3e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
512 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  33.81 
 
 
512 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  33.81 
 
 
512 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  32.45 
 
 
511 aa  202  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  33.09 
 
 
542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  33.09 
 
 
511 aa  201  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  31.68 
 
 
511 aa  201  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  33.81 
 
 
512 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  31.97 
 
 
511 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  33.9 
 
 
494 aa  200  5e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  32.46 
 
 
511 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  32.46 
 
 
511 aa  199  9e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  32.46 
 
 
511 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  32.46 
 
 
511 aa  199  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  32.22 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  32.22 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  32.22 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  30.09 
 
 
534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  31.31 
 
 
515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  32.22 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  32.22 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  34.28 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  32.94 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  31.58 
 
 
495 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  31.06 
 
 
519 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  32.61 
 
 
512 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  32.57 
 
 
498 aa  196  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  31.34 
 
 
523 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  31.79 
 
 
501 aa  196  8.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 
511 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 
517 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 
517 aa  195  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  35.01 
 
 
512 aa  194  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  31.83 
 
 
524 aa  193  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  32.85 
 
 
512 aa  193  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  33.09 
 
 
512 aa  193  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  34.76 
 
 
516 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  30.37 
 
 
517 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  32.03 
 
 
522 aa  190  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  33.64 
 
 
512 aa  189  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  29.55 
 
 
519 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  32.19 
 
 
528 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 
511 aa  188  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  29.44 
 
 
530 aa  188  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  29.91 
 
 
530 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  30.39 
 
 
505 aa  187  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  31.15 
 
 
521 aa  187  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  30.36 
 
 
531 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  29.25 
 
 
519 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  30.45 
 
 
519 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  31.91 
 
 
535 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1607  integral membrane protein MviN  31.22 
 
 
469 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.916233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  31.68 
 
 
535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>