More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1607 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1607  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 469 aa  910    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.916233  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1294  integral membrane protein MviN  52.85 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0335761  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0861  integral membrane protein MviN  39.83 
 
 		 473 aa  339  8e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.371179  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0838  integral membrane protein MviN  40.47 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  39.02 
 
 		 494 aa  310  2.9999999999999997e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  31.22 
 
 		 534 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  33.03 
 
 		 494 aa  195  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  30.26 
 
 		 523 aa  193  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  31.21 
 
 		 522 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 		 518 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  29.31 
 
 		 524 aa  187  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  31.16 
 
 		 495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 		 521 aa  183  6e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  30.5 
 
 		 519 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  29.9 
 
 		 529 aa  182  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  30.5 
 
 		 519 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  30.32 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  30.32 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  30.32 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  29.52 
 
 		 505 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 		 521 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  30.32 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  30.37 
 
 		 501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  32.95 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  28.64 
 
 		 522 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  30.05 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  29.06 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 		 521 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 		 530 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 		 519 aa  177  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  27.34 
 
 		 515 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  26.96 
 
 		 515 aa  176  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  31.7 
 
 		 521 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 		 534 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.65 
 
 		 526 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  29.9 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  30.63 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  30.05 
 
 		 519 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  28.94 
 
 		 523 aa  173  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  29.17 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  29.88 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  30.28 
 
 		 519 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  30.63 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  30.21 
 
 		 519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  27.88 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  26.44 
 
 		 513 aa  163  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  28.09 
 
 		 531 aa  163  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  26.45 
 
 		 516 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  26.44 
 
 		 495 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  26.9 
 
 		 511 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  30.13 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  27.21 
 
 		 511 aa  160  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 		 523 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  27.75 
 
 		 529 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  26.97 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  29.69 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  29.58 
 
 		 525 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  26.77 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  27.04 
 
 		 524 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  28.08 
 
 		 518 aa  156  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  28.95 
 
 		 511 aa  156  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  25.76 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 		 531 aa  156  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 		 512 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  27.98 
 
 		 528 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  29.21 
 
 		 522 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  26.43 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  27.17 
 
 		 520 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0631  virulence factor protein MviN  31.41 
 
 		 488 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0373858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  25.87 
 
 		 512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 		 511 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  29.09 
 
 		 521 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 		 517 aa  153  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  28.72 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  27.87 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  25.73 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  27.3 
 
 		 511 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  26.3 
 
 		 512 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  26.47 
 
 		 534 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  26.45 
 
 		 512 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  29.89 
 
 		 522 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  28.85 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  26.22 
 
 		 512 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 		 511 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 		 542 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  28 
 
 		 526 aa  149  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  26.22 
 
 		 512 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 		 530 aa  149  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  28.2 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  28.2 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 		 513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  28.2 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  25.52 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  28.2 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  29.22 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>