More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0861 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0838  integral membrane protein MviN  94.29 
 
 		 473 aa  871    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0861  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 473 aa  931    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.371179  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1607  integral membrane protein MviN  42.05 
 
 		 469 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.916233  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1294  integral membrane protein MviN  40.41 
 
 		 476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0335761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  35.68 
 
 		 494 aa  263  4.999999999999999e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  36.21 
 
 		 522 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  32.39 
 
 		 529 aa  213  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  33.95 
 
 		 530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  31.29 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  31.29 
 
 		 515 aa  193  6e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  29.45 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  29.45 
 
 		 517 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  29.96 
 
 		 518 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  32.19 
 
 		 512 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  33.48 
 
 		 498 aa  188  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  31.18 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 		 519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  31.53 
 
 		 519 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  32.72 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  30.81 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  30.81 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  30.57 
 
 		 522 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  30.25 
 
 		 524 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  29.96 
 
 		 501 aa  179  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  31.03 
 
 		 521 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  30.75 
 
 		 521 aa  176  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  31.18 
 
 		 519 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  30.4 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  30.6 
 
 		 512 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  30.57 
 
 		 519 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  32.87 
 
 		 522 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  30.11 
 
 		 523 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  33.63 
 
 		 513 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  30.88 
 
 		 519 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  29.95 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  31.97 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  30.44 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  28.26 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  28.33 
 
 		 520 aa  170  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  28.63 
 
 		 519 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  31.7 
 
 		 541 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  30.48 
 
 		 521 aa  169  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  33.01 
 
 		 511 aa  169  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  30.58 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  30.68 
 
 		 512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  28.76 
 
 		 519 aa  167  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  29.68 
 
 		 511 aa  167  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  32.39 
 
 		 525 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 		 534 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  31 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  29.69 
 
 		 511 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  29.36 
 
 		 511 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  29.24 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  30.82 
 
 		 528 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  28.67 
 
 		 495 aa  164  5.0000000000000005e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  28.22 
 
 		 505 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  30.68 
 
 		 535 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  29.87 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  29.1 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  29.09 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  29.87 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  31.79 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  31.35 
 
 		 519 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  30.54 
 
 		 535 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  28.5 
 
 		 516 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  31.79 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  31.79 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  31.79 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  29.8 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  31.79 
 
 		 524 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  28.18 
 
 		 494 aa  161  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  31.72 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  28.49 
 
 		 521 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  32.03 
 
 		 524 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  29.51 
 
 		 518 aa  160  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  30.54 
 
 		 535 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  28.83 
 
 		 534 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  30.47 
 
 		 511 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  28.49 
 
 		 522 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 512 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  29.26 
 
 		 530 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  29.22 
 
 		 519 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  32.64 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  29.4 
 
 		 526 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  31.03 
 
 		 512 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  29.77 
 
 		 512 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  29.84 
 
 		 526 aa  157  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  27.77 
 
 		 573 aa  156  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  31.08 
 
 		 514 aa  156  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 		 534 aa  156  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  26.87 
 
 		 514 aa  156  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  31.96 
 
 		 511 aa  156  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  31.96 
 
 		 511 aa  156  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  31.96 
 
 		 511 aa  156  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  31.96 
 
 		 511 aa  156  9e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  31.96 
 
 		 511 aa  156  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  31.96 
 
 		 511 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>