More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0838 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0861  integral membrane protein MviN  94.29 
 
 		 473 aa  871    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.371179  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0838  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 473 aa  934    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1607  integral membrane protein MviN  42.92 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.916233  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1294  integral membrane protein MviN  38.88 
 
 		 476 aa  300  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0335761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1786  integral membrane protein MviN  35.27 
 
 		 494 aa  257  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  33.2 
 
 		 522 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  31.74 
 
 		 529 aa  213  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  33.73 
 
 		 530 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  30.28 
 
 		 515 aa  189  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  30.28 
 
 		 515 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  33.57 
 
 		 512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  30.81 
 
 		 519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 519 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  29.71 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  28.46 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  28.46 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  32.7 
 
 		 519 aa  183  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  29.35 
 
 		 518 aa  180  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 		 519 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  30.17 
 
 		 524 aa  179  7e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 		 522 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  30.9 
 
 		 519 aa  177  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 		 519 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 		 522 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  30.41 
 
 		 519 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  30.55 
 
 		 521 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  31.07 
 
 		 519 aa  174  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  32.94 
 
 		 498 aa  173  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  28.17 
 
 		 520 aa  173  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  30.17 
 
 		 519 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  30.86 
 
 		 521 aa  172  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  29.69 
 
 		 523 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  30.32 
 
 		 501 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 		 513 aa  169  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 		 495 aa  169  9e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  31.09 
 
 		 525 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  29.38 
 
 		 511 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  30.09 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  27.87 
 
 		 508 aa  167  2.9999999999999998e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  29.53 
 
 		 519 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  30.83 
 
 		 521 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  29.35 
 
 		 523 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  31.47 
 
 		 541 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  29.81 
 
 		 512 aa  166  9e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  30.3 
 
 		 519 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  31.14 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  29.82 
 
 		 511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  29.52 
 
 		 523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  28.81 
 
 		 505 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  28.85 
 
 		 521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  29.45 
 
 		 518 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  30.6 
 
 		 512 aa  163  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  30.52 
 
 		 534 aa  163  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  32.44 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  29.9 
 
 		 531 aa  162  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  26.87 
 
 		 514 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  29.64 
 
 		 535 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  29.64 
 
 		 535 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  28.64 
 
 		 494 aa  161  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  27.79 
 
 		 495 aa  160  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 		 535 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  31.47 
 
 		 529 aa  160  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 524 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 524 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 524 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  29.4 
 
 		 512 aa  160  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 524 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 524 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  28.1 
 
 		 516 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  28.04 
 
 		 526 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  30.59 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  30.59 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  28.78 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  29.1 
 
 		 517 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  29.81 
 
 		 528 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  27.41 
 
 		 573 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  30.59 
 
 		 512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  32.23 
 
 		 511 aa  157  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 		 513 aa  156  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  29.06 
 
 		 534 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  28.25 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  28.77 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  28.09 
 
 		 511 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  31.35 
 
 		 511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  31.35 
 
 		 511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  31.35 
 
 		 511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  28.85 
 
 		 530 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  31.35 
 
 		 511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  31.35 
 
 		 511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  29.94 
 
 		 524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  31.35 
 
 		 511 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  31.35 
 
 		 511 aa  154  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  31.35 
 
 		 511 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  31.35 
 
 		 511 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>