More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0967 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 501 aa  979    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  38.88 
 
 		 497 aa  311  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 529 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  35.94 
 
 		 522 aa  273  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  36.34 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  32.42 
 
 		 521 aa  265  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  34.89 
 
 		 522 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  36.64 
 
 		 511 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 		 511 aa  263  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  36.87 
 
 		 512 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  35.86 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 		 511 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 		 511 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 		 511 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 		 511 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 		 511 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  36.09 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  36.26 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  36.09 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  36.09 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  35.4 
 
 		 511 aa  260  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 524 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 524 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 524 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 524 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  35.99 
 
 		 524 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  36.42 
 
 		 512 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  35.4 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  35.17 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  36.64 
 
 		 512 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  35.93 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  36.95 
 
 		 511 aa  256  5e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  36.87 
 
 		 512 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  36.87 
 
 		 512 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  37.41 
 
 		 528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  36.05 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  34.8 
 
 		 516 aa  255  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  35.62 
 
 		 511 aa  254  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  35.62 
 
 		 542 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 519 aa  254  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  32.83 
 
 		 519 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  32.83 
 
 		 519 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  36.32 
 
 		 508 aa  253  6e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  32.68 
 
 		 521 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  37.16 
 
 		 514 aa  251  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  34.58 
 
 		 521 aa  250  5e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  36.32 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 		 498 aa  249  8e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  30.64 
 
 		 519 aa  249  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  33.71 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  36.41 
 
 		 522 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  33.03 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  33.91 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  32.8 
 
 		 519 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  32.95 
 
 		 522 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  32.11 
 
 		 518 aa  247  3e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  32.8 
 
 		 519 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  32.8 
 
 		 519 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  33.55 
 
 		 519 aa  247  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  32.18 
 
 		 524 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 519 aa  246  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  35.17 
 
 		 512 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  33.73 
 
 		 511 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  36.42 
 
 		 528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  33.89 
 
 		 517 aa  243  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  33.89 
 
 		 521 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  33.89 
 
 		 517 aa  243  5e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  31.15 
 
 		 523 aa  243  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  33.8 
 
 		 516 aa  243  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  35.09 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  36.81 
 
 		 512 aa  242  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  32.88 
 
 		 523 aa  242  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  34.75 
 
 		 521 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  36.41 
 
 		 513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  36.78 
 
 		 512 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  30.9 
 
 		 523 aa  240  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 517 aa  240  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  32.8 
 
 		 517 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  33.79 
 
 		 519 aa  237  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  35.25 
 
 		 512 aa  237  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  33.77 
 
 		 515 aa  236  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  32.94 
 
 		 519 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  32.73 
 
 		 521 aa  236  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  34.55 
 
 		 511 aa  236  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  36.54 
 
 		 521 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  32.57 
 
 		 530 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  35.71 
 
 		 512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  34.51 
 
 		 531 aa  233  5e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  33.76 
 
 		 516 aa  233  5e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  31.75 
 
 		 505 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  33.55 
 
 		 515 aa  233  6e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  30.85 
 
 		 526 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  33.72 
 
 		 533 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  33.12 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  35.08 
 
 		 513 aa  229  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 		 512 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  31.97 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  37.02 
 
 		 509 aa  227  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>