More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0631 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0631  virulence factor protein MviN  100 
 
 		 488 aa  946    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0373858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0892  integral membrane protein MviN  68.05 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.695883  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0822  integral membrane protein MviN  68.05 
 
 		 483 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.690946  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1209  integral membrane protein MviN  67.22 
 
 		 483 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.4186  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0578  integral membrane protein MviN  49.66 
 
 		 465 aa  384  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.990523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0789  integral membrane protein MviN  49.22 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0480496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1053  integral membrane protein MviN  46.86 
 
 		 469 aa  364  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1211  virulence factor MVIN-like  45.63 
 
 		 468 aa  362  6e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1143  integral membrane protein MviN  45.88 
 
 		 466 aa  358  8e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  33.04 
 
 		 498 aa  196  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  32.64 
 
 		 518 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  33.7 
 
 		 522 aa  186  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  31.47 
 
 		 529 aa  186  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  33.18 
 
 		 511 aa  186  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  32.96 
 
 		 518 aa  184  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  32.29 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  32.96 
 
 		 519 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  30.63 
 
 		 530 aa  180  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  31.41 
 
 		 519 aa  179  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  32.19 
 
 		 519 aa  179  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  32.79 
 
 		 512 aa  179  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  31.41 
 
 		 519 aa  179  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  30.92 
 
 		 522 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  31.13 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  31.06 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  31.13 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  31.13 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  29.16 
 
 		 505 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  32.26 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  31.13 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 		 519 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  31.09 
 
 		 495 aa  177  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  31.21 
 
 		 524 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  30.79 
 
 		 531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  31.2 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  30.38 
 
 		 523 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  31.63 
 
 		 519 aa  173  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  32.58 
 
 		 521 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  31.41 
 
 		 519 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  31.43 
 
 		 525 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  30.09 
 
 		 511 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  31.95 
 
 		 512 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  28.44 
 
 		 525 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  30.3 
 
 		 542 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  30.3 
 
 		 511 aa  170  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  30.86 
 
 		 521 aa  169  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  29.13 
 
 		 511 aa  169  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  34.46 
 
 		 501 aa  169  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  30.86 
 
 		 512 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  29.6 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  31.69 
 
 		 519 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  29.6 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  28.7 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  29.65 
 
 		 524 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  29.65 
 
 		 524 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  29.65 
 
 		 524 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  29.65 
 
 		 524 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  29.65 
 
 		 524 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  29.63 
 
 		 511 aa  166  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  29.82 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  29.35 
 
 		 511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  29.78 
 
 		 513 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  29.82 
 
 		 512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  29.3 
 
 		 512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 		 508 aa  163  7e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  30.48 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  29.51 
 
 		 511 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  28.82 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  29.6 
 
 		 512 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  28.51 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  29.02 
 
 		 516 aa  161  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.64 
 
 		 511 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 		 515 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  28.3 
 
 		 513 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  30.89 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  29.74 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  29.74 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 		 528 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  33.43 
 
 		 509 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 		 511 aa  158  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1607  integral membrane protein MviN  31.41 
 
 		 469 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.916233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  28.09 
 
 		 573 aa  157  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 		 511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  29.15 
 
 		 511 aa  156  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  31.74 
 
 		 521 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0587  integral membrane protein MviN  29 
 
 		 523 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.354322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  31.05 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  29.69 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  29.35 
 
 		 528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  28.26 
 
 		 512 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  29.84 
 
 		 512 aa  154  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2251  membrane protein MviN  33.43 
 
 		 513 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0136199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  29.04 
 
 		 513 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>