More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1211 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1211  virulence factor MVIN-like  100 
 
 
468 aa  919    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1053  integral membrane protein MviN  54.7 
 
 
469 aa  472  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0578  integral membrane protein MviN  53.96 
 
 
465 aa  474  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.990523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0789  integral membrane protein MviN  55.01 
 
 
466 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0480496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1143  integral membrane protein MviN  51.41 
 
 
466 aa  428  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0892  integral membrane protein MviN  44.56 
 
 
483 aa  358  8e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.695883  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0822  integral membrane protein MviN  44.56 
 
 
483 aa  358  8e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.690946  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1209  integral membrane protein MviN  44.81 
 
 
483 aa  355  1e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.4186  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0631  virulence factor protein MviN  45.63 
 
 
488 aa  346  4e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0373858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  31.91 
 
 
498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
528 aa  197  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  33.49 
 
 
522 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  31.35 
 
 
505 aa  194  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  31.62 
 
 
529 aa  193  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  34.05 
 
 
495 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  32.12 
 
 
511 aa  193  7e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  32.86 
 
 
512 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  33.11 
 
 
530 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  32.16 
 
 
523 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  31.88 
 
 
511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  31.82 
 
 
512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
511 aa  190  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  32.31 
 
 
512 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  31.22 
 
 
511 aa  191  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
542 aa  190  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  32.78 
 
 
511 aa  189  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  32.78 
 
 
511 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  32.78 
 
 
511 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  32.78 
 
 
511 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  32.78 
 
 
511 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  32.54 
 
 
511 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  32.54 
 
 
511 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  32.31 
 
 
512 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  32.54 
 
 
511 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  32.54 
 
 
511 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  32.08 
 
 
512 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  30.92 
 
 
511 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  31.59 
 
 
518 aa  186  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  30.88 
 
 
511 aa  186  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  31.95 
 
 
515 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  30.63 
 
 
529 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  33.64 
 
 
517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  30.13 
 
 
511 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  33.03 
 
 
512 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  32.07 
 
 
524 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  32.07 
 
 
524 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  32.07 
 
 
524 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  32.07 
 
 
524 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  32.07 
 
 
524 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  30.96 
 
 
573 aa  183  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  31.42 
 
 
511 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  31.29 
 
 
519 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  31.29 
 
 
519 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  31.43 
 
 
522 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  30.09 
 
 
519 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  31.72 
 
 
515 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  33.94 
 
 
511 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  32.34 
 
 
509 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  34.52 
 
 
501 aa  179  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  30.07 
 
 
524 aa  179  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  31.06 
 
 
519 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  31.79 
 
 
519 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  30.07 
 
 
516 aa  179  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  31.92 
 
 
516 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  31.06 
 
 
519 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  31.06 
 
 
519 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  31.06 
 
 
519 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  31.32 
 
 
532 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  30.04 
 
 
530 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  31.01 
 
 
521 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  31.35 
 
 
512 aa  177  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  30.63 
 
 
555 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  31.74 
 
 
528 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  30.52 
 
 
495 aa  176  5e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  32.17 
 
 
521 aa  176  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  29.37 
 
 
519 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  32.11 
 
 
509 aa  177  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  30.49 
 
 
530 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  31.5 
 
 
526 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  31.47 
 
 
525 aa  176  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 
508 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 
534 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  30.37 
 
 
517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  28.45 
 
 
511 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  30.54 
 
 
529 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  31.06 
 
 
519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  29.62 
 
 
519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  29.34 
 
 
519 aa  173  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 
513 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  30.97 
 
 
523 aa  173  6.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  32.24 
 
 
517 aa  172  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3538  virulence factor MVIN-like  31.63 
 
 
513 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.32091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  31.44 
 
 
511 aa  172  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  34.49 
 
 
509 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  33.02 
 
 
513 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 
517 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 
519 aa  172  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  30.59 
 
 
519 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 
517 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1621  integral membrane protein MviN  33.01 
 
 
509 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>