More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0789 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0789  integral membrane protein MviN  100 
 
 
466 aa  907    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0480496  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0578  integral membrane protein MviN  65.83 
 
 
465 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.990523  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1211  virulence factor MVIN-like  55.01 
 
 
468 aa  478  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1143  integral membrane protein MviN  56.99 
 
 
466 aa  468  9.999999999999999e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1053  integral membrane protein MviN  54.37 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0892  integral membrane protein MviN  48.5 
 
 
483 aa  375  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.695883  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1209  integral membrane protein MviN  48.3 
 
 
483 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.4186  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0822  integral membrane protein MviN  48.5 
 
 
483 aa  375  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.690946  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0631  virulence factor protein MviN  49 
 
 
488 aa  369  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0373858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  34.99 
 
 
522 aa  217  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  33.97 
 
 
511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  34.88 
 
 
511 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  34.37 
 
 
511 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  35.12 
 
 
511 aa  210  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  35.12 
 
 
542 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  34.71 
 
 
512 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  34.22 
 
 
511 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  34.73 
 
 
505 aa  209  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  33.42 
 
 
511 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  34.22 
 
 
512 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  34.81 
 
 
511 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  35.13 
 
 
528 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  32.45 
 
 
517 aa  207  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  32.45 
 
 
517 aa  207  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  34.81 
 
 
511 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  33.9 
 
 
512 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  33.9 
 
 
512 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  34.15 
 
 
524 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  34.15 
 
 
524 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  34.15 
 
 
524 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  34.15 
 
 
524 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  34.15 
 
 
524 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  33.5 
 
 
511 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  33.5 
 
 
511 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  33.74 
 
 
511 aa  205  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  33.5 
 
 
511 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  33.74 
 
 
511 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  33.74 
 
 
511 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  33.5 
 
 
511 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  33.74 
 
 
511 aa  205  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  33.74 
 
 
511 aa  205  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  36.87 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 
522 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  34.27 
 
 
519 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  33.89 
 
 
529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  35.82 
 
 
509 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 
521 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 
508 aa  199  6e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 
531 aa  199  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  35.21 
 
 
517 aa  199  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  33.73 
 
 
512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 
530 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  33.49 
 
 
523 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  31.25 
 
 
498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  34.35 
 
 
513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  34.11 
 
 
519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  35.31 
 
 
509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  35.38 
 
 
512 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  33.56 
 
 
519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  33.56 
 
 
519 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 
511 aa  196  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  35.12 
 
 
512 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  35.09 
 
 
518 aa  195  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  33.1 
 
 
519 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  33.18 
 
 
524 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  32.64 
 
 
519 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  32.64 
 
 
519 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  32.64 
 
 
519 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  33.18 
 
 
519 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  33.99 
 
 
512 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  34.05 
 
 
508 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  34.06 
 
 
512 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  32.24 
 
 
516 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  34.63 
 
 
509 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  32.48 
 
 
519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  34.86 
 
 
517 aa  190  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  29.71 
 
 
528 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  32.05 
 
 
495 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  32.95 
 
 
519 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  33.1 
 
 
522 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  33.49 
 
 
518 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  33.1 
 
 
510 aa  187  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  34.63 
 
 
528 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  33.1 
 
 
519 aa  187  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  33.8 
 
 
519 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  33.82 
 
 
534 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  33.89 
 
 
514 aa  186  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  34.98 
 
 
508 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  34.11 
 
 
511 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  29.6 
 
 
526 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  31.82 
 
 
515 aa  185  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  30.52 
 
 
529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  33.1 
 
 
519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 
516 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  31.92 
 
 
532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  34.63 
 
 
513 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  32 
 
 
495 aa  184  4.0000000000000006e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  35.02 
 
 
508 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  33.09 
 
 
512 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  33.1 
 
 
519 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>