More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1053 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1053  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 469 aa  927    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1211  virulence factor MVIN-like  54.7 
 
 		 468 aa  488  1e-136  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0578  integral membrane protein MviN  53.1 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.990523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0789  integral membrane protein MviN  54.37 
 
 		 466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0480496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1143  integral membrane protein MviN  52.8 
 
 		 466 aa  437  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1209  integral membrane protein MviN  45.2 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.4186  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0892  integral membrane protein MviN  45.97 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.695883  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0822  integral membrane protein MviN  45.97 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.690946  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0631  virulence factor protein MviN  46.86 
 
 		 488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0373858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  35.51 
 
 		 498 aa  213  7.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 512 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  35 
 
 		 512 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  35 
 
 		 512 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  35 
 
 		 512 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  35.66 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  34.43 
 
 		 511 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  34.17 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  34.17 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  34.17 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  34.17 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  33.94 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  33.94 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  33.94 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  33.94 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  33.94 
 
 		 511 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  33.69 
 
 		 511 aa  200  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  33.71 
 
 		 524 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  33.71 
 
 		 524 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  33.71 
 
 		 524 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  33.71 
 
 		 524 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  33.71 
 
 		 524 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  31.8 
 
 		 512 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  32.43 
 
 		 511 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  36.45 
 
 		 529 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  32.55 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  32.01 
 
 		 511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  33.8 
 
 		 530 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  32.84 
 
 		 511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  34.84 
 
 		 513 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  33.69 
 
 		 511 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  33.69 
 
 		 542 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  35.19 
 
 		 513 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  32.37 
 
 		 531 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  35.46 
 
 		 518 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  33.64 
 
 		 511 aa  194  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  31.73 
 
 		 511 aa  193  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  35.03 
 
 		 495 aa  193  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  33.11 
 
 		 528 aa  193  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 526 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  32.58 
 
 		 529 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  34.32 
 
 		 512 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  35.52 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  32.38 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  34.17 
 
 		 512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  35.37 
 
 		 514 aa  190  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  32.11 
 
 		 529 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  34.62 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  31.58 
 
 		 555 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  34.4 
 
 		 512 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  34.47 
 
 		 511 aa  186  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  32.44 
 
 		 517 aa  186  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  32.44 
 
 		 517 aa  186  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  32.85 
 
 		 508 aa  186  1.0000000000000001e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  32.05 
 
 		 530 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  31.83 
 
 		 530 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  34.58 
 
 		 522 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  34.76 
 
 		 521 aa  181  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  30.92 
 
 		 519 aa  181  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  32.57 
 
 		 519 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  30.59 
 
 		 524 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  34.47 
 
 		 528 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  31.95 
 
 		 519 aa  179  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  33.1 
 
 		 495 aa  179  1e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  31.89 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  32.05 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 		 519 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  32.39 
 
 		 528 aa  177  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  33.04 
 
 		 515 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 		 508 aa  177  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  33.04 
 
 		 515 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  32.28 
 
 		 534 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  31.29 
 
 		 523 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 		 519 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  31.63 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  32.37 
 
 		 521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 		 519 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  31.53 
 
 		 519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  33.04 
 
 		 525 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  32.03 
 
 		 516 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  31.31 
 
 		 523 aa  172  7.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 		 519 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  31.88 
 
 		 519 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  32.45 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  31.49 
 
 		 519 aa  172  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  31 
 
 		 521 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 		 522 aa  172  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>