More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0578 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0578  integral membrane protein MviN  100 
 
 
465 aa  903    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.990523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0789  integral membrane protein MviN  65.83 
 
 
466 aa  531  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0480496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1143  integral membrane protein MviN  60 
 
 
466 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1211  virulence factor MVIN-like  53.96 
 
 
468 aa  474  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1053  integral membrane protein MviN  53.1 
 
 
469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0892  integral membrane protein MviN  48.72 
 
 
483 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.695883  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0822  integral membrane protein MviN  48.72 
 
 
483 aa  394  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.690946  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1209  integral membrane protein MviN  48.72 
 
 
483 aa  391  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.4186  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0631  virulence factor protein MviN  49.66 
 
 
488 aa  369  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0373858  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  35.98 
 
 
529 aa  197  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  34.12 
 
 
518 aa  187  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3297  integral membrane protein MviN  35.52 
 
 
509 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3620  integral membrane protein MviN  35.52 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.834109  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  31.72 
 
 
517 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  31.72 
 
 
517 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  33.9 
 
 
512 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  33.82 
 
 
498 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1306  integral membrane protein MviN  33.1 
 
 
508 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 
525 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  34.89 
 
 
511 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  34.89 
 
 
511 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  34.89 
 
 
511 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  34.89 
 
 
511 aa  180  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  34.89 
 
 
511 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  34.89 
 
 
511 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  34.89 
 
 
511 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  34.89 
 
 
511 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  34.89 
 
 
511 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  32.61 
 
 
512 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 
522 aa  180  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  32.69 
 
 
522 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  33.72 
 
 
528 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  32.63 
 
 
522 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  31.57 
 
 
511 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  32.29 
 
 
512 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  34.59 
 
 
519 aa  177  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  33.01 
 
 
530 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  34.15 
 
 
511 aa  177  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  31.56 
 
 
511 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  31.24 
 
 
495 aa  176  8e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
519 aa  176  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
511 aa  176  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  33.17 
 
 
513 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 
524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  30.08 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 
524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 
524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 
524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  34.23 
 
 
524 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  33.01 
 
 
512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  33.57 
 
 
518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  31.63 
 
 
511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4498  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
508 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  31.7 
 
 
511 aa  173  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  32.54 
 
 
505 aa  173  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
512 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  31.97 
 
 
511 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  30.77 
 
 
511 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  32.41 
 
 
519 aa  172  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  34.69 
 
 
519 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  32.11 
 
 
542 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  31.75 
 
 
511 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 
519 aa  172  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  32.41 
 
 
519 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  34.3 
 
 
495 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4500  integral membrane protein MviN  32.68 
 
 
509 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.305851  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  34.43 
 
 
512 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  31.26 
 
 
525 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
524 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  32.86 
 
 
519 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  33.49 
 
 
512 aa  171  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  30.8 
 
 
519 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  32.29 
 
 
512 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  31.19 
 
 
509 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
519 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  31.72 
 
 
515 aa  169  9e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  32.09 
 
 
519 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  32.09 
 
 
519 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  32.09 
 
 
519 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  31.06 
 
 
520 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  32.69 
 
 
523 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  32.18 
 
 
521 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5611  putative virulence factor MviN-like protein  31.36 
 
 
509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0199453  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  31.72 
 
 
515 aa  167  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1019  integral membrane protein MviN  31.68 
 
 
510 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0896  integral membrane protein MviN  31.43 
 
 
543 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.474692 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  32.32 
 
 
573 aa  166  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  31.38 
 
 
521 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  29.61 
 
 
526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1610  integral membrane protein MviN  31.82 
 
 
534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  33.91 
 
 
517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  30.98 
 
 
523 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1078  virulence factor MVIN-like  32.84 
 
 
508 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.342174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  31.88 
 
 
516 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  31.02 
 
 
531 aa  163  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  30.66 
 
 
513 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  30.5 
 
 
513 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  32.64 
 
 
519 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  30.75 
 
 
523 aa  162  9e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  33.25 
 
 
514 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>