More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1470 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  100 
 
 
523 aa  1010    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  38.64 
 
 
521 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0885  integral membrane protein MviN  40.47 
 
 
518 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000255547  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  40.22 
 
 
512 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  37.42 
 
 
514 aa  264  4e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  36.67 
 
 
534 aa  263  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  31.87 
 
 
523 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  33.65 
 
 
524 aa  240  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  32.15 
 
 
526 aa  237  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  28.46 
 
 
521 aa  226  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  30.74 
 
 
521 aa  224  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  35.06 
 
 
556 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  29.79 
 
 
521 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 
522 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  32.1 
 
 
495 aa  209  1e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
533 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  32.33 
 
 
494 aa  205  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  28.38 
 
 
528 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  29.1 
 
 
531 aa  197  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 
515 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  30.77 
 
 
522 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  27.55 
 
 
539 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  30.24 
 
 
529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  29.28 
 
 
531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0122  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  31.68 
 
 
496 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000511918  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  28.02 
 
 
521 aa  183  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  30.04 
 
 
521 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  28.65 
 
 
519 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  29.64 
 
 
522 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  29.05 
 
 
523 aa  180  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  29.63 
 
 
537 aa  180  5.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  27.86 
 
 
518 aa  180  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  28.83 
 
 
523 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  28.95 
 
 
512 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  28.51 
 
 
495 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  27.2 
 
 
519 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  29.1 
 
 
522 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  27.57 
 
 
515 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  26.05 
 
 
525 aa  177  5e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  27.98 
 
 
521 aa  177  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  27.67 
 
 
525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  27.13 
 
 
511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  28.75 
 
 
523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  29 
 
 
520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  29.05 
 
 
505 aa  174  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  28.27 
 
 
512 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 
517 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  27.51 
 
 
511 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  28.91 
 
 
517 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  27.57 
 
 
515 aa  172  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  28.27 
 
 
521 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  28.5 
 
 
512 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  27.14 
 
 
514 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  27.32 
 
 
524 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  27.32 
 
 
524 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  27.32 
 
 
524 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  27.32 
 
 
524 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  27.32 
 
 
524 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  28.14 
 
 
519 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  28.02 
 
 
512 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  28.14 
 
 
519 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  25.96 
 
 
526 aa  168  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4951  MVIN-like virulence factor  29.61 
 
 
490 aa  167  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00259183  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  29.16 
 
 
511 aa  167  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  26.8 
 
 
519 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  27.88 
 
 
519 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 
526 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  28.85 
 
 
498 aa  166  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  27.73 
 
 
511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  27.96 
 
 
511 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0342  integral membrane protein MviN  30.62 
 
 
537 aa  164  3e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5561  integral membrane protein MviN  28.28 
 
 
492 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  28.63 
 
 
519 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  27.08 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  27.08 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  27.93 
 
 
519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  27.27 
 
 
530 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  27.72 
 
 
519 aa  163  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  27.29 
 
 
512 aa  163  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 
524 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  27.29 
 
 
512 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  25.42 
 
 
511 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 
516 aa  161  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  27.19 
 
 
512 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  27.51 
 
 
519 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  26.58 
 
 
519 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  25.92 
 
 
508 aa  160  5e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  26.13 
 
 
511 aa  160  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  29.93 
 
 
501 aa  160  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 
522 aa  160  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
519 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
519 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 
519 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>