More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0342 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0342  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 537 aa  1041    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  34.15 
 
 		 521 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  34.08 
 
 		 522 aa  260  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  34.47 
 
 		 528 aa  256  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  39.18 
 
 		 537 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  34.59 
 
 		 531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  32.66 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  32.66 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  31.26 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  33.33 
 
 		 521 aa  236  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  34.79 
 
 		 529 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  33.85 
 
 		 522 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  34.45 
 
 		 526 aa  231  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  31.37 
 
 		 523 aa  231  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  33 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  34.02 
 
 		 495 aa  225  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  30.85 
 
 		 519 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  30.85 
 
 		 519 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  29.4 
 
 		 516 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  30.58 
 
 		 517 aa  223  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  32.1 
 
 		 519 aa  223  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 573 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  34.9 
 
 		 522 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  33.26 
 
 		 523 aa  221  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0922  integral membrane protein MviN  30.31 
 
 		 521 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000322348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  34.97 
 
 		 521 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 521 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  33.55 
 
 		 523 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  30.07 
 
 		 521 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  31.6 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  31.6 
 
 		 512 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  30.85 
 
 		 519 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  31.6 
 
 		 512 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  31.08 
 
 		 508 aa  217  4e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  30.63 
 
 		 519 aa  216  7e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  31.48 
 
 		 519 aa  216  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  30.23 
 
 		 519 aa  216  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  30.57 
 
 		 519 aa  216  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  30.02 
 
 		 511 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  31.22 
 
 		 505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 		 534 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  31.6 
 
 		 512 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  32.81 
 
 		 512 aa  213  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  33.64 
 
 		 498 aa  213  7.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  29.4 
 
 		 519 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  29.4 
 
 		 519 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  29.4 
 
 		 519 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  29.4 
 
 		 519 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  30.58 
 
 		 517 aa  210  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3534  MviN protein  30.79 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 		 524 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  28.92 
 
 		 530 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  29.14 
 
 		 545 aa  208  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  31.99 
 
 		 515 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  32.21 
 
 		 513 aa  207  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  33.11 
 
 		 516 aa  207  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  28.83 
 
 		 530 aa  207  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  30.22 
 
 		 521 aa  206  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  29.62 
 
 		 524 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  31.99 
 
 		 515 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  32.44 
 
 		 521 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  29.62 
 
 		 524 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  29.62 
 
 		 524 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  29.62 
 
 		 524 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  29.62 
 
 		 524 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  30.34 
 
 		 511 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  30.34 
 
 		 511 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  30.34 
 
 		 511 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  30.34 
 
 		 511 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  30.34 
 
 		 511 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  30.34 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  30.34 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  30.34 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  30.34 
 
 		 511 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  30.79 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  30.75 
 
 		 519 aa  204  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  28.38 
 
 		 511 aa  203  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  29.24 
 
 		 517 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  28.38 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  29.05 
 
 		 517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  29.14 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  29.44 
 
 		 535 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  29.36 
 
 		 521 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  29.14 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  28.32 
 
 		 542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  28.83 
 
 		 511 aa  201  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  30.41 
 
 		 512 aa  200  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  28.82 
 
 		 525 aa  200  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 		 521 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  29.52 
 
 		 535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  28.29 
 
 		 513 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  29.67 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  28.44 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  31.31 
 
 		 512 aa  197  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3273  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 		 521 aa  197  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  28.6 
 
 		 511 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  27.99 
 
 		 511 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  30.08 
 
 		 518 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  30.11 
 
 		 520 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>