More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1776 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  79.85 
 
 
521 aa  776    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  100 
 
 
521 aa  993    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  65.45 
 
 
545 aa  672    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  69.87 
 
 
521 aa  678    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  77.54 
 
 
573 aa  780    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  79.08 
 
 
545 aa  786    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  68.33 
 
 
521 aa  664    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  79.65 
 
 
532 aa  775    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  65.64 
 
 
517 aa  616  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  65.26 
 
 
521 aa  615  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  66.41 
 
 
520 aa  609  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  57.58 
 
 
516 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  58.05 
 
 
517 aa  554  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  56.7 
 
 
530 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  56.9 
 
 
530 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  53.74 
 
 
534 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  55.09 
 
 
517 aa  521  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0532  integral membrane protein MviN  54.13 
 
 
516 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  53.55 
 
 
516 aa  495  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5882  virulence factor MVIN-like  53.17 
 
 
516 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176913  normal  0.480668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  53.55 
 
 
516 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0378  integral membrane protein MviN  53.74 
 
 
516 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0921  integral membrane protein MviN  53.74 
 
 
516 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.432333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0678  integral membrane protein MviN  53.74 
 
 
539 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0736  integral membrane protein MviN  52.98 
 
 
539 aa  487  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2599  integral membrane protein MviN  53.36 
 
 
516 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2513  integral membrane protein MviN  53.74 
 
 
592 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1076  integral membrane protein MviN  53.74 
 
 
606 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.656695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0924  integral membrane protein MviN  53.74 
 
 
592 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2574  integral membrane protein MviN  53.36 
 
 
516 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0127  integral membrane protein MviN  53.74 
 
 
592 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2550  integral membrane protein MviN  53.36 
 
 
516 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2469  integral membrane protein MviN  53.36 
 
 
516 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0186654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1938  integral membrane protein MviN  53.36 
 
 
546 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.919423  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  54.51 
 
 
517 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0746  integral membrane protein MviN  53.36 
 
 
516 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.533432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  48.28 
 
 
516 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  46.85 
 
 
512 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  49.06 
 
 
512 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  46.85 
 
 
512 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  49.33 
 
 
511 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  46.85 
 
 
512 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  44.49 
 
 
511 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  44 
 
 
524 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  44 
 
 
524 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  45.12 
 
 
512 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  44 
 
 
524 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  47.24 
 
 
513 aa  415  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  44 
 
 
524 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  44 
 
 
524 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  46.85 
 
 
512 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  43.92 
 
 
511 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  44.11 
 
 
511 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  45.54 
 
 
511 aa  412  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  44.4 
 
 
511 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  44.4 
 
 
542 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  44.4 
 
 
511 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  43.43 
 
 
511 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  50.29 
 
 
512 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  44.4 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  43.62 
 
 
511 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  43.62 
 
 
511 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  43.62 
 
 
511 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  43.62 
 
 
511 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  43.62 
 
 
511 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  43.62 
 
 
511 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  43.62 
 
 
511 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  43.62 
 
 
511 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  43.62 
 
 
511 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  44.74 
 
 
512 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  45.7 
 
 
512 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  42.69 
 
 
508 aa  395  1e-108  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  44.28 
 
 
513 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  44.74 
 
 
528 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  45.99 
 
 
512 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  44.32 
 
 
530 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  44.1 
 
 
512 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  45.82 
 
 
514 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  43.48 
 
 
495 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  45.8 
 
 
522 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  42.64 
 
 
518 aa  365  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  39.22 
 
 
523 aa  357  3.9999999999999996e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  39.22 
 
 
523 aa  356  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  42.37 
 
 
522 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  40.59 
 
 
498 aa  352  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  41.12 
 
 
515 aa  349  6e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  42.31 
 
 
522 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  41.31 
 
 
515 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  41.41 
 
 
517 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  41.41 
 
 
517 aa  345  2e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  37.72 
 
 
511 aa  332  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  37.57 
 
 
520 aa  329  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  38.1 
 
 
516 aa  325  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  36.62 
 
 
523 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  36.52 
 
 
519 aa  324  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  37.53 
 
 
519 aa  323  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  37.5 
 
 
519 aa  323  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  36.42 
 
 
519 aa  323  5e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  36.42 
 
 
519 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  36.97 
 
 
531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>