More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2444 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 548 aa  1059    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  55.93 
 
 		 535 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  55.93 
 
 		 535 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  55.7 
 
 		 535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  50.39 
 
 		 541 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  40.27 
 
 		 528 aa  316  9e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  38.34 
 
 		 521 aa  296  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  40.92 
 
 		 522 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  38.69 
 
 		 511 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  36.6 
 
 		 529 aa  277  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  41.84 
 
 		 521 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  39.66 
 
 		 521 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  35.35 
 
 		 511 aa  273  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  40.45 
 
 		 522 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  37.2 
 
 		 511 aa  270  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  35.53 
 
 		 511 aa  270  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  39.2 
 
 		 530 aa  269  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  37.79 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  34.96 
 
 		 542 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  36.08 
 
 		 512 aa  267  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  34.75 
 
 		 511 aa  266  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  35.13 
 
 		 511 aa  266  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 524 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 524 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 524 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 524 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 		 524 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  39.61 
 
 		 521 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  38.57 
 
 		 526 aa  265  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  37.16 
 
 		 530 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  37.39 
 
 		 530 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  35.55 
 
 		 523 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  40.05 
 
 		 522 aa  263  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  38.4 
 
 		 534 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  39.75 
 
 		 520 aa  261  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  38.1 
 
 		 513 aa  261  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  38.44 
 
 		 512 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  33.2 
 
 		 511 aa  259  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  38.81 
 
 		 512 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  39.5 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  36.49 
 
 		 512 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  36.8 
 
 		 512 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  36.8 
 
 		 512 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  39.68 
 
 		 522 aa  257  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  38.13 
 
 		 517 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  38.13 
 
 		 512 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  37.44 
 
 		 525 aa  256  9e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  37.39 
 
 		 517 aa  256  9e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  38.86 
 
 		 573 aa  256  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  37.06 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  42.17 
 
 		 524 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  38.99 
 
 		 513 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  33.13 
 
 		 508 aa  255  2.0000000000000002e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  36.51 
 
 		 519 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  36.77 
 
 		 532 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  36.77 
 
 		 521 aa  253  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  36.67 
 
 		 512 aa  253  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  37.31 
 
 		 529 aa  252  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  35.23 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  35.23 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4034  integral membrane protein MviN  39.23 
 
 		 528 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.419875  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  35.23 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  35.73 
 
 		 545 aa  252  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  36.29 
 
 		 519 aa  251  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  39.27 
 
 		 521 aa  251  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  40.48 
 
 		 512 aa  250  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  34.34 
 
 		 519 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  35.64 
 
 		 512 aa  250  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  35.12 
 
 		 516 aa  249  9e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  38.43 
 
 		 517 aa  249  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  38.43 
 
 		 517 aa  249  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  34.34 
 
 		 519 aa  249  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  38.65 
 
 		 511 aa  248  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  35.35 
 
 		 519 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  38.2 
 
 		 495 aa  247  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  36.29 
 
 		 518 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  35.8 
 
 		 511 aa  246  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3138  integral membrane protein MviN  33.92 
 
 		 519 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000568418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  38.49 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  33.88 
 
 		 545 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  35.48 
 
 		 524 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  35.12 
 
 		 520 aa  243  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  35.35 
 
 		 519 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  37.85 
 
 		 521 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  35.35 
 
 		 519 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  35.35 
 
 		 519 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  37.15 
 
 		 521 aa  242  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  34.51 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  35.12 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  35.65 
 
 		 519 aa  242  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  40.91 
 
 		 512 aa  240  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  39.26 
 
 		 511 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 516 aa  239  9e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  34.06 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>