More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3077 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3077  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 543 aa  1038    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112933  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3190  integral membrane protein MviN  81.38 
 
 		 599 aa  723    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000159661  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2971  integral membrane protein MviN  42.52 
 
 		 525 aa  306  9.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000053192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  40.28 
 
 		 613 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  33.9 
 
 		 521 aa  226  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  36.82 
 
 		 514 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  37.17 
 
 		 521 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  30.86 
 
 		 514 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  37.59 
 
 		 528 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  35.21 
 
 		 523 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  29.42 
 
 		 525 aa  194  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  36.6 
 
 		 519 aa  193  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  34.42 
 
 		 521 aa  193  7e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  33.4 
 
 		 521 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  32.35 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  32.35 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 524 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 524 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 524 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 524 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 524 aa  186  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 		 529 aa  186  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  34.7 
 
 		 513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  35 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 		 511 aa  183  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  32.19 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 515 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  31.96 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  31.05 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  31.05 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  34.68 
 
 		 524 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  33.33 
 
 		 515 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 		 511 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  34.86 
 
 		 512 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  34.64 
 
 		 526 aa  176  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  34.61 
 
 		 512 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  30.89 
 
 		 542 aa  176  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 		 522 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  31.11 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  34.58 
 
 		 495 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  32.71 
 
 		 518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  31.51 
 
 		 528 aa  174  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  34.1 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  30.59 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  30.68 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  28.36 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  32.52 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  33.58 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  32.7 
 
 		 531 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  34.61 
 
 		 512 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  31.48 
 
 		 516 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  30.04 
 
 		 516 aa  170  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  32.81 
 
 		 520 aa  170  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  31.57 
 
 		 522 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  33.33 
 
 		 512 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  34.34 
 
 		 512 aa  166  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  31.25 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0678  integral membrane protein MviN  31.19 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  35.71 
 
 		 513 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3202  integral membrane protein MviN  31.52 
 
 		 516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0924  integral membrane protein MviN  31.19 
 
 		 592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2513  integral membrane protein MviN  31.19 
 
 		 592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1076  integral membrane protein MviN  31.19 
 
 		 606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.656695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 		 517 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0127  integral membrane protein MviN  31.19 
 
 		 592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0760  virulence factor MVIN-like  31.21 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  25.78 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  31.36 
 
 		 505 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  31.96 
 
 		 573 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  33.99 
 
 		 524 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  24.63 
 
 		 523 aa  163  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1938  integral membrane protein MviN  31.87 
 
 		 546 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.919423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  33.4 
 
 		 521 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0378  integral membrane protein MviN  31.1 
 
 		 516 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0921  integral membrane protein MviN  31.1 
 
 		 516 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.432333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  30.79 
 
 		 534 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  31.65 
 
 		 523 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  33.74 
 
 		 536 aa  162  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  28.34 
 
 		 521 aa  161  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  32.44 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  32.98 
 
 		 512 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  28.82 
 
 		 495 aa  160  6e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  32.82 
 
 		 522 aa  159  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  31.72 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  33.5 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  32.65 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2574  integral membrane protein MviN  31.78 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2550  integral membrane protein MviN  31.78 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  29.31 
 
 		 530 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  31.13 
 
 		 545 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  32.82 
 
 		 521 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>