More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2971 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2971  integral membrane protein MviN  100 
 
 
525 aa  1017    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000053192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  45.64 
 
 
613 aa  306  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3077  integral membrane protein MviN  41.46 
 
 
543 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000112933  hitchhiker  0.00318015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3190  integral membrane protein MviN  41.54 
 
 
599 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000159661  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  31.3 
 
 
521 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  31.96 
 
 
514 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  33.26 
 
 
523 aa  193  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  30.23 
 
 
539 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  35.63 
 
 
526 aa  190  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  34.26 
 
 
521 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0707  integral membrane protein MviN  29.32 
 
 
514 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  31.78 
 
 
521 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  32.61 
 
 
533 aa  182  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  32.28 
 
 
521 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  33.63 
 
 
524 aa  177  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  28.42 
 
 
521 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  31.33 
 
 
528 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  27.83 
 
 
525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  30.68 
 
 
529 aa  163  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  27.5 
 
 
523 aa  163  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  31.01 
 
 
511 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  29.76 
 
 
505 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  29.25 
 
 
522 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  32.15 
 
 
534 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  33.5 
 
 
548 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  27.76 
 
 
534 aa  153  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  30.48 
 
 
521 aa  153  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  29.31 
 
 
526 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  25.38 
 
 
494 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  30.47 
 
 
530 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  32.11 
 
 
517 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  30.09 
 
 
514 aa  150  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  24.9 
 
 
549 aa  150  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 
511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0761  integral membrane protein MviN  30.3 
 
 
495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 
512 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  32.9 
 
 
536 aa  146  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  30.19 
 
 
534 aa  146  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  27.21 
 
 
501 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  30.96 
 
 
524 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  29.9 
 
 
521 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  29.53 
 
 
521 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.29 
 
 
511 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  32.64 
 
 
536 aa  144  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  29.35 
 
 
522 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  31.12 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  29.52 
 
 
515 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  30.92 
 
 
511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 
524 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 
524 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 
524 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 
524 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  29.98 
 
 
519 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 
524 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  26.82 
 
 
523 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  29.98 
 
 
515 aa  140  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  27.65 
 
 
523 aa  140  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
531 aa  140  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
511 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  29.14 
 
 
522 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  28.4 
 
 
511 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 
511 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 
511 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  29.39 
 
 
517 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  28.4 
 
 
511 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 
511 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  29.39 
 
 
517 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 
511 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  30.72 
 
 
513 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 
511 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 
511 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  28.4 
 
 
511 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  30.97 
 
 
512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  30.53 
 
 
512 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  27.74 
 
 
542 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  29.49 
 
 
516 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  30.12 
 
 
535 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0865  virulence factor MVIN family protein  29.88 
 
 
444 aa  137  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156001  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  30.05 
 
 
522 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  27.01 
 
 
511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  30 
 
 
511 aa  136  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  30.21 
 
 
521 aa  136  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  30.73 
 
 
512 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  31.86 
 
 
535 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 
511 aa  136  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  29.2 
 
 
530 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  28.36 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  28.06 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  31.62 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  29.79 
 
 
517 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  28.51 
 
 
530 aa  135  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  27.22 
 
 
521 aa  134  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  33.5 
 
 
556 aa  135  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  31.36 
 
 
517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  33.67 
 
 
519 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  27.36 
 
 
522 aa  133  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  28.22 
 
 
495 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>