More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3225 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  100 
 
 
517 aa  990    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  56.89 
 
 
528 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0370  integral membrane protein MviN  55.73 
 
 
519 aa  478  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.601407  normal  0.501558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0452  integral membrane protein MviN  42.48 
 
 
526 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  33.21 
 
 
523 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  33.33 
 
 
521 aa  223  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  38.07 
 
 
526 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
529 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  33.62 
 
 
522 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  35.51 
 
 
521 aa  201  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  34.32 
 
 
521 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  33.62 
 
 
521 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  30.06 
 
 
521 aa  196  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  34.42 
 
 
524 aa  193  7e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  35.48 
 
 
530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  35.22 
 
 
530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  30.99 
 
 
522 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  33.78 
 
 
526 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  30.13 
 
 
531 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0967  integral membrane protein MviN  28.74 
 
 
501 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.218762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  34.47 
 
 
511 aa  183  7e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  30.61 
 
 
522 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  31.68 
 
 
521 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  34.14 
 
 
517 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  33.52 
 
 
533 aa  179  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  33.87 
 
 
511 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  33.87 
 
 
511 aa  178  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  30.11 
 
 
521 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  34.29 
 
 
512 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  33.51 
 
 
512 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  33.51 
 
 
512 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  34.13 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  34.29 
 
 
512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  33.88 
 
 
556 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  34.13 
 
 
511 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  32.87 
 
 
513 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  32.64 
 
 
522 aa  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  32.98 
 
 
511 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  32.94 
 
 
522 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
524 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
524 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
524 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
524 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  34.13 
 
 
524 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 
521 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  31.1 
 
 
539 aa  171  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  33.6 
 
 
511 aa  171  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
511 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  26.8 
 
 
525 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  36.49 
 
 
513 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  33.79 
 
 
526 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3237  integral membrane protein MviN  29.75 
 
 
519 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000353864  normal  0.701129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1119  integral membrane protein MviN  29.75 
 
 
519 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000138654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  33.16 
 
 
511 aa  167  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1052  integral membrane protein MviN  29.75 
 
 
519 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  33.16 
 
 
542 aa  167  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  31.89 
 
 
511 aa  167  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  31.94 
 
 
573 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1154  integral membrane protein MviN  29.53 
 
 
519 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0012618  normal  0.115609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  31.72 
 
 
512 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  31.88 
 
 
520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  31.48 
 
 
528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  31.88 
 
 
518 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 
519 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  31.19 
 
 
521 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 
613 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1192  integral membrane protein MviN  29.31 
 
 
519 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000262812  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  32.35 
 
 
521 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  30.02 
 
 
533 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  31.69 
 
 
514 aa  163  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2959  integral membrane protein MviN  28.42 
 
 
519 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000122374  normal  0.858488 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  30.17 
 
 
515 aa  162  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  33.64 
 
 
517 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  33.64 
 
 
517 aa  162  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1057  integral membrane protein MviN  29.49 
 
 
519 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0994487  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3041  integral membrane protein MviN  28.42 
 
 
519 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000507063  normal  0.815511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  29.25 
 
 
531 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  32.12 
 
 
515 aa  160  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  34.18 
 
 
495 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  29.03 
 
 
534 aa  160  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1081  integral membrane protein MviN  28.57 
 
 
519 aa  160  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00472684  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  30.53 
 
 
516 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 
521 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2892  integral membrane protein MviN  28.03 
 
 
524 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  31.2 
 
 
512 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  31.28 
 
 
534 aa  159  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  31.64 
 
 
541 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  32.2 
 
 
532 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  32.08 
 
 
534 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  34.59 
 
 
536 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 
519 aa  158  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  31.55 
 
 
516 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  31.77 
 
 
517 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>