More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4533 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  69.67 
 
 		 657 aa  719    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 918 aa  1793    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  46.4 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  42.94 
 
 		 526 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  38.1 
 
 		 621 aa  347  5e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  41.71 
 
 		 532 aa  334  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  33.29 
 
 		 899 aa  333  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  39.52 
 
 		 534 aa  332  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  39.18 
 
 		 627 aa  330  8e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  37.48 
 
 		 1217 aa  325  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  41.59 
 
 		 535 aa  305  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  44.67 
 
 		 674 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  38.76 
 
 		 568 aa  295  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  38.27 
 
 		 533 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  36.76 
 
 		 610 aa  269  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  35.79 
 
 		 552 aa  269  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5093  integral membrane protein MviN  38.96 
 
 		 580 aa  263  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000635167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  34.87 
 
 		 1219 aa  261  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4575  integral membrane protein MviN  39.33 
 
 		 592 aa  261  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0630035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  35.89 
 
 		 521 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  33.15 
 
 		 1219 aa  251  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  35.79 
 
 		 546 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  38.58 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4797  integral membrane protein MviN  36.69 
 
 		 665 aa  221  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0842  integral membrane protein MviN  34.2 
 
 		 1209 aa  220  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6064  integral membrane protein MviN  34.88 
 
 		 1224 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  33.48 
 
 		 1184 aa  211  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  36.02 
 
 		 580 aa  210  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5400  integral membrane protein MviN  35.47 
 
 		 1263 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5489  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 		 1184 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.250379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5776  integral membrane protein MviN  36.08 
 
 		 1168 aa  202  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24398  normal  0.429874 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  32.42 
 
 		 565 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  29.29 
 
 		 1652 aa  191  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  34.91 
 
 		 517 aa  189  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  32.35 
 
 		 569 aa  188  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  30.85 
 
 		 715 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  32.26 
 
 		 708 aa  187  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  29.31 
 
 		 700 aa  177  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  30.97 
 
 		 552 aa  175  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  29.23 
 
 		 560 aa  172  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  34.4 
 
 		 535 aa  171  6e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  31.91 
 
 		 530 aa  157  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  30.92 
 
 		 563 aa  154  5.9999999999999996e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.56 
 
 		 535 aa  154  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  29.36 
 
 		 575 aa  152  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  27.1 
 
 		 598 aa  152  4e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  30.1 
 
 		 523 aa  149  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  29.45 
 
 		 529 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  29.52 
 
 		 614 aa  145  5e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  27.92 
 
 		 521 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  26.81 
 
 		 511 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  28.9 
 
 		 521 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  26.42 
 
 		 511 aa  131  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  28.27 
 
 		 526 aa  129  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  27.25 
 
 		 544 aa  128  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  28.38 
 
 		 522 aa  127  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  27.66 
 
 		 511 aa  127  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  27.66 
 
 		 511 aa  127  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  27.66 
 
 		 511 aa  127  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  28.47 
 
 		 522 aa  127  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  27.66 
 
 		 511 aa  127  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  27.99 
 
 		 511 aa  127  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 511 aa  126  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 511 aa  126  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 511 aa  126  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 511 aa  126  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  27.83 
 
 		 511 aa  126  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 511 aa  126  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  27.21 
 
 		 511 aa  125  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  28.89 
 
 		 521 aa  125  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31860  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  29.82 
 
 		 579 aa  124  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.683518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  29.32 
 
 		 648 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 524 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 524 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 524 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 524 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 524 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  30.84 
 
 		 532 aa  122  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  28.19 
 
 		 521 aa  122  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  26.41 
 
 		 511 aa  120  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 		 517 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 		 517 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  30.75 
 
 		 538 aa  118  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  26.91 
 
 		 511 aa  118  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  26.19 
 
 		 522 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  26.46 
 
 		 542 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  28.6 
 
 		 533 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  29.95 
 
 		 526 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  28.54 
 
 		 521 aa  115  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  26.37 
 
 		 522 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  30.7 
 
 		 541 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  28.64 
 
 		 549 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 		 518 aa  114  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  30.51 
 
 		 535 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  26.46 
 
 		 511 aa  114  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.25 
 
 		 588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  30.08 
 
 		 535 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  27.02 
 
 		 522 aa  113  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  30.79 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 		 545 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>