295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3004 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3004  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 		 541 aa  977    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2175  virulence factor MVIN family protein  51.08 
 
 		 527 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134074  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2007  virulence factor MVIN family protein  51.78 
 
 		 552 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.4064  normal  0.087601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5413  virulence factor MVIN family protein  46.41 
 
 		 648 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6052  membrane protein putative virulence factor-like protein  43.27 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1908  virulence factor MVIN family protein  50.21 
 
 		 567 aa  289  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146225  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2351  virulence factor MVIN family protein  48.78 
 
 		 538 aa  283  8.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.257245  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2027  hypothetical protein  45.84 
 
 		 539 aa  282  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1917  virulence factor MVIN family protein  50.11 
 
 		 568 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.731846  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3021  virulence factor MVIN family protein  47.24 
 
 		 540 aa  266  8.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.378839 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1130  virulence factor MVIN family protein  39.15 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1346  virulence factor MVIN family protein  41.63 
 
 		 557 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.817252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22090  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  48.58 
 
 		 964 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.339262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3143  virulence factor MVIN family protein  44.86 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0110938  normal  0.770926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1663  virulence factor MVIN family protein  44.51 
 
 		 541 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.45805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13710  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  38.38 
 
 		 588 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.721621  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2604  integral membrane protein MviN  35.69 
 
 		 517 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7324  integral membrane protein MviN  31.26 
 
 		 657 aa  137  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2142  integral membrane protein MviN  29.76 
 
 		 559 aa  127  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.296197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9372  membrane protein putative virulence factor-like protein  28.74 
 
 		 534 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4159  integral membrane protein MviN  28.88 
 
 		 708 aa  124  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3926  integral membrane protein MviN  29.42 
 
 		 715 aa  121  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3715  integral membrane protein MviN  31.81 
 
 		 580 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.516983  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5082  integral membrane protein MviN  34.53 
 
 		 674 aa  120  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0925894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  32.29 
 
 		 533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  32.85 
 
 		 535 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4683  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 552 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.499252  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  29.84 
 
 		 537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4533  integral membrane protein MviN  30.5 
 
 		 918 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2117  virulence factor MVIN family protein  26.28 
 
 		 700 aa  109  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0993652  normal  0.569404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4497  integral membrane protein MviN  31.15 
 
 		 570 aa  108  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3574  integral membrane protein MviN  27.92 
 
 		 532 aa  107  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0027  integral membrane protein MviN  32.6 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  27.15 
 
 		 521 aa  102  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  26.94 
 
 		 521 aa  101  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  25.58 
 
 		 529 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08730  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  22.8 
 
 		 563 aa  100  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.201008  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4965  integral membrane protein MviN  27.96 
 
 		 526 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  25.97 
 
 		 526 aa  100  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26920  integral membrane protein MviN  30.17 
 
 		 560 aa  99.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  25.28 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39630  integral membrane protein MviN  28.61 
 
 		 610 aa  98.6  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.783158  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  28.2 
 
 		 627 aa  97.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4853  integral membrane protein MviN  28.64 
 
 		 621 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.188841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37920  integral membrane protein MviN  27.68 
 
 		 565 aa  95.9  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4226  virulence factor MVIN family protein  28.81 
 
 		 1219 aa  94.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7082  virulence factor MVIN family protein  28.99 
 
 		 521 aa  94.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  27.22 
 
 		 521 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  25.88 
 
 		 515 aa  93.2  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  25.82 
 
 		 515 aa  91.7  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  27.98 
 
 		 1217 aa  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2545  integral membrane protein MviN  26.87 
 
 		 552 aa  90.9  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0233456  normal  0.204601 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09620  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  28.04 
 
 		 535 aa  90.1  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  0.0121961 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1446  hypothetical protein  23.77 
 
 		 575 aa  90.1  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  26.8 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0939  virulence factor MVIN family protein  24.69 
 
 		 544 aa  88.6  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4852  integral membrane protein MviN  27.9 
 
 		 568 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  27.88 
 
 		 498 aa  87  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6435  integral membrane protein MviN  28.88 
 
 		 546 aa  86.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.318853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  25.48 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4843  virulence factor MVIN family protein  28.7 
 
 		 1219 aa  85.1  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  26.86 
 
 		 613 aa  84.3  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  25.3 
 
 		 519 aa  84  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13945  transmembrane protein  27.96 
 
 		 1184 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  27.11 
 
 		 521 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2468  integral membrane protein MviN  30.15 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  24.75 
 
 		 516 aa  82.4  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  26.37 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  29.74 
 
 		 535 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1882  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 		 527 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  27.85 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0056  putative integral membrane protein MviN  23.73 
 
 		 598 aa  80.9  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9038  integral membrane protein MviN  26.57 
 
 		 899 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  22.5 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  28.28 
 
 		 1652 aa  80.1  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  26.29 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  21.22 
 
 		 549 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  28.19 
 
 		 538 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3023  integral membrane protein MviN  27.46 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  26.25 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  29.53 
 
 		 535 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  27.16 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1758  MviN family virulence factor  23.74 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.155059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  29.84 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  25.9 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23360  integral membrane protein MviN  31.07 
 
 		 614 aa  77  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3365  virulence factor MVIN family protein  26.23 
 
 		 569 aa  77  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  29.68 
 
 		 556 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  27.53 
 
 		 530 aa  76.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2039  integral membrane protein MviN  23.8 
 
 		 516 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0629584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  29.31 
 
 		 535 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  28.14 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  30.48 
 
 		 533 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  26.39 
 
 		 521 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  22.75 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  26.88 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  25.25 
 
 		 511 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  25.36 
 
 		 522 aa  74.7  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>